RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480171.7

PKP4-210, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 2,772 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-210ENST00000480171 RAP2BP61225 183 aa7.96□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 ISXQ2M1V0 245 aa7.96□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 TCTE1Q5JU00 501 aa7.96□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 OLFML2AQ68BL7 652 aa7.96□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 KIRREL2Q6UWL6 708 aa7.96□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa7.96□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 SLC38A6Q8IZM9 456 aa7.96□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 ZNF565Q8N9K5 539 aa7.96□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 OR5T3Q8NGG3 340 aa7.96□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 ASB12Q8WXK4 309 aa7.96□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 HERVK_113Q902F9 699 aa7.96□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 PIGKQ92643 395 aa7.96□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 MSANTD3Q96H12 275 aa7.96□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 RBP7Q96R05 134 aa7.96□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 NMNAT3Q96T66 252 aa7.96□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 POT1Q9NUX5 634 aa7.96□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 POMT2Q9UKY4 750 aa7.96□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 COPS3Q9UNS2 423 aa7.96□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 FLVCR2Q9UPI3 526 aa7.96□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 POM121BA6NF01 834 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 ACOD1A6NK06 481 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 EFCAB7A8K855 629 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 L7N2F9 121 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 ACOT7O00154 380 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 GLCEO94923 617 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 GIPP09681 153 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 CPN1P15169 458 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 RPS2P15880 293 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 FAUP35544 74 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 PRPS1P60891 318 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 OPCMLQ14982 345 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 WDR73Q6P4I2 378 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 Q6ZTK2 550 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 PRSS41Q7RTY9 318 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 CSNK1A1LQ8N752 337 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 NPEPL1Q8NDH3 523 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 SYNPRQ8TBG9 265 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 FAM3CQ92520 227 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 CCDC120Q96HB5 630 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 DDOQ99489 341 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 CCDC3Q9BQI4 270 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 G6PC3Q9BUM1 346 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 RXFP3Q9NSD7 469 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 TAS2R5Q9NYW4 299 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 KIF25Q9UIL4 384 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 FBXL3Q9UKT7 428 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 ETV7Q9Y603 341 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 A0A1W2PPL8 197 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 SNRPGP15A8MWD9 76 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 PIN1P1O15428 100 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 ALDOBP05062 364 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 IL5P05113 134 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 ADRB1P08588 477 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 TNFRSF4P43489 277 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 ZNF141Q15928 474 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 NDUFAF6Q330K2 333 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 LRRN1Q6UXK5 716 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 SERPINA12Q8IW75 414 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 NSMAFQ92636 917 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 HAVCR1Q96D42 359 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 SLC25A38Q96DW6 304 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 FBRSQ9HAH7 460 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 RDH8Q9NYR8 311 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 HCN3Q9P1Z3 774 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 FOXJ3Q9UPW0 622 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 SCN2AQ99250 2005 aa7.95□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 A0A087WUJ7 227 aa7.94□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 PIAS2O75928 621 aa7.94□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 MNDAP41218 407 aa7.94□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 GRK6P43250 576 aa7.94□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 PTH2RP49190 550 aa7.94□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 PPP2CBP62714 309 aa7.94□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 ERVK-25P63136 954 aa7.94□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 PPP2CAP67775 309 aa7.94□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 PSG6Q00889 435 aa7.94□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 DHODHQ02127 395 aa7.94□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 GPR18Q14330 331 aa7.94□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 TMEM240Q5SV17 173 aa7.94□□□□□ -1.14
PKP4-210ENST00000480171 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms