RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 RCE1Q9Y256 329 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 UNC119BA6NIH7 251 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 ANXA2P2A6NMY6 339 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 F8W036 122 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SOCS6O14544 535 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 ARPC5O15511 151 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 NDUFS4O43181 175 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 EMC8O43402 210 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 FMO6PO60774 539 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 HRGP04196 525 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SBK2P0C263 348 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 OR2T7P0C7T2 308 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 MPIP34949 423 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 STARP49675 285 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 OR10A3P58181 314 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA1024LP59773 190 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 MC2RQ01718 297 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 C9orf64Q5T6V5 341 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 PLBD1Q6P4A8 553 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM220Q6QAJ8 160 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 APOOLQ6UXV4 268 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 DPPA4Q7L190 304 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 NRMQ8IXM6 262 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 OR1M1Q8NGA1 313 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 OR2T27Q8NH04 317 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 OR51Q1Q8NH59 317 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 OR4C6Q8NH72 309 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 GANCQ8TET4 914 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 MYLIPQ8WY64 445 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 THAP4Q8WY91 577 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 GHSRQ92847 366 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC46Q96FV0 321 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SLC41A3Q96GZ6 507 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 C4orf36Q96KX1 117 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 PGLYRP3Q96LB9 341 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 CXorf58Q96LI9 332 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 DPH7Q9BTV6 452 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 OR10A4Q9H209 315 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 PIAS3Q9Y6X2 628 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 COL4A2P08572 1712 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 H7BY64 318 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 J3QLW9 94 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 OR2F2O95006 317 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 CH25HO95992 272 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 CHRM4P08173 479 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD34CP0C6C1 535 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF19P17023 458 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ATF1P18846 271 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 CD40P25942 277 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 NTSR1P30989 418 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 GDI2P50395 445 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ART1P52961 327 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 REEP5Q00765 189 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 FZD5Q13467 585 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 OR2F1Q13607 317 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 SLC9A5Q14940 896 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 KIR3DS1Q14943 382 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 CDK5R1Q15078 307 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 VOPP1Q96AW1 172 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 TEAD3Q99594 435 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 C12orf57Q99622 126 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 MCHR1Q99705 422 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 SEC22CQ9BRL7 303 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 OR52D1Q9H346 318 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 GLIPR2Q9H4G4 154 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 EQTNQ9NQ60 294 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 CD84Q9UIB8 345 aa6.59□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 TBC1D3EA0A087X179 549 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 PRSS38A1L453 326 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 OR14I1A6ND48 311 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 ACOD1A6NK06 481 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 RFPL4AA6NLU0 287 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-201ENST00000372616 IFITM5A6NNB3 132 aa6.58□□□□□ -1.36
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