RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339987.7

SDCBP2-201, Transcript of syndecan binding protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SDCBP2, Length 1,404 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2-201ENST00000339987 P4HA3Q7Z4N8 544 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 ZGRF1Q86YA3 2104 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 GALNT11Q8NCW6 608 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 OR52L1Q8NGH7 329 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 OR8D4Q8NGM9 314 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 SAMD8Q96LT4 415 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 RNF122Q9H9V4 155 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 TBC1D23Q9NUY8 699 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 KLHL9Q9P2J3 617 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 FAM215AQ9Y5M1 114 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 MCIDASD6RGH6 385 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 C11orf98E9PRG8 122 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 H3BN98 237 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 RNF13O43567 381 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 C1QL1O75973 258 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 IGHMP01871 453 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 PRB1P04280 392 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 CD14P08571 375 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 AHCYP23526 432 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 VHLP40337 213 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 CRISP1P54107 249 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 TLE1Q04724 770 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 NPRL3Q12980 569 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 UEVLDQ8IX04 471 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 KDM8Q8N371 416 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 OR9K2Q8NGE7 335 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 TEX47Q8TBZ9 253 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 TM9SF2Q99805 663 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 ENKD1Q9H0I2 346 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 BCO1Q9HAY6 547 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 GLRX2Q9NS18 164 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 KLHL13Q9P2N7 655 aa15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 DLGAP1O14490 977 aa15.93■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 F13BP05160 661 aa15.93■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 APEHP13798 732 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 ZNF43P17038 809 aa15.93■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 RPL4P36578 427 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 CASP6P55212 293 aa15.93■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 CTXN1P60606 82 aa15.93■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 PLXDC2Q6UX71 529 aa15.93■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa15.93■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 GPAT4Q86UL3 456 aa15.93■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 MCEMP1Q8IX19 187 aa15.93■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 ABHD3Q8WU67 409 aa15.93■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 TSSK6Q9BXA6 273 aa15.93■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 RIBC2Q9H4K1 309 aa15.93■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 SLC25A19Q9HC21 320 aa15.93■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 NRIP3Q9NQ35 241 aa15.93■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 EMC3Q9P0I2 261 aa15.93■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 TINAGQ9UJW2 476 aa15.93■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 BAIAP2Q9UQB8 552 aa15.93■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 A0A1W2PRG6 482 aa15.92■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 ZNF724A8MTY0 619 aa15.92■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 GPR171O14626 319 aa15.92■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 SNAP29O95721 258 aa15.92■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 HLA-DOBP13765 273 aa15.92■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 POU1F1P28069 291 aa15.92■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 TIMP3P35625 211 aa15.92■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 CA7P43166 264 aa15.92■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 C1DQ13901 141 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 OR2A2Q6IF42 318 aa15.92■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 SEM1Q6ZVN7 128 aa15.92■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 CREB3L2Q70SY1 520 aa15.92■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 IGFN1Q86VF2 1251 aa15.92■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 C9orf106Q8NAJ2 232 aa15.92■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 KATNB1Q9BVA0 655 aa15.92■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 IFT27Q9BW83 186 aa15.92■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 TXNIPQ9H3M7 391 aa15.92■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 TOR3AQ9H497 397 aa15.92■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 IL20RAQ9UHF4 553 aa15.92■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa15.92■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 E9PQ18 207 aa15.91■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 BHLHE40O14503 412 aa15.91■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 IMPA2O14732 288 aa15.91■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 ARPC3O15145 178 aa15.91■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 IDH3BO43837 385 aa15.91■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 TXNDC12O95881 172 aa15.91■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 STSP08842 583 aa15.91■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 GIPRP48546 466 aa15.91■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 DAP3P51398 398 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 RPS6KA3P51812 740 aa15.91■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 CDK5Q00535 292 aa15.91■□□□□ 0.14
SDCBP2-201ENST00000339987 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms