RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 RRASP10301 218 aa10.35□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 PTNP21246 168 aa10.35□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP10.35□□□□□ -0.752e-7■■■□□ 16.3
HCG18-241ENST00000602290 MASP1P48740 699 aa10.35□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 STARP49675 285 aa10.35□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 RAB38P57729 211 aa10.35□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 EMX2Q04743 252 aa10.35□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 RUNX2Q13950 521 aa10.35□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 FGFBP1Q14512 234 aa10.35□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 PRPSAP1Q14558 356 aa10.35□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 ZNF273Q14593 569 aa10.35□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 CORO6Q6QEF8 472 aa10.35□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 TFAP2EQ6VUC0 442 aa10.35□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 ZNF793Q6ZN11 406 aa10.35□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa10.35□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 SPATA19Q7Z5L4 167 aa10.35□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 C17orf64Q86WR6 236 aa10.35□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 OR4K1Q8NGD4 311 aa10.35□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 TUBGCP3Q96CW5 907 aa10.35□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 CCDC90BQ9GZT6 254 aa10.35□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 ARL15Q9NXU5 204 aa10.35□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 WWOXQ9NZC7 414 aa10.35□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 ERVK-18Q9QC07 812 aa10.35□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 RIMKLBQ9ULI2 386 aa10.35□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 TMCC3Q9ULS5 477 aa10.35□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 SACSQ9NZJ4 4579 aa10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 TRBC2A0A5B9 178 aa10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 KRBOX1C9JBD0 128 aa10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 H3BUI4 141 aa10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 CYR61O00622 381 aa10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 TPST1O60507 370 aa10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 EEDO75530 441 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 APOC1P02654 83 aa10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 MT-ND2P03891 347 aa10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 FGF4P08620 206 aa10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 BTF3P20290 206 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 FMO4P31512 558 aa10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 LIPEQ05469 1076 aa10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 LAPTM5Q13571 262 aa10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 QPRTQ15274 297 aa10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 TOMM20Q15388 145 aa10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
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HCG18-241ENST00000602290 GLYATQ6IB77 296 aa10.34□□□□□ -0.75
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HCG18-241ENST00000602290 P4HA3Q7Z4N8 544 aa10.34□□□□□ -0.75
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HCG18-241ENST00000602290 YIPF7Q8N8F6 280 aa10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 DUSP18Q8NEJ0 188 aa10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 FAM110BQ8TC76 370 aa10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 MARC2Q969Z3 335 aa10.34□□□□□ -0.75
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HCG18-241ENST00000602290 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 PCBD2Q9H0N5 130 aa10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 KLHL31Q9H511 634 aa10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
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HCG18-241ENST00000602290 FANCFQ9NPI8 374 aa10.34□□□□□ -0.75
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HCG18-241ENST00000602290 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
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HCG18-241ENST00000602290 COPS7AQ9UBW8 275 aa10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 KIF25Q9UIL4 384 aa10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 SNX6Q9UNH7 406 aa10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 PSAT1Q9Y617 370 aa10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 COMMD10Q9Y6G5 202 aa10.34□□□□□ -0.75
HCG18-241ENST00000602290 PQLC2LA1A4F0 135 aa10.33□□□□□ -0.76
HCG18-241ENST00000602290 B4DXG7 233 aa10.33□□□□□ -0.76
HCG18-241ENST00000602290 E9PQ18 207 aa10.33□□□□□ -0.76
HCG18-241ENST00000602290 NDUFS8O00217 210 aa10.33□□□□□ -0.76
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HCG18-241ENST00000602290 NIPSNAP2O75323 286 aa10.33□□□□□ -0.76
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HCG18-241ENST00000602290 HKR1P10072 659 aa10.33□□□□□ -0.76
HCG18-241ENST00000602290 DDCP20711 480 aa10.33□□□□□ -0.76
HCG18-241ENST00000602290 CBLP22681 906 aa10.33□□□□□ -0.76
HCG18-241ENST00000602290 TTPAP49638 278 aa10.33□□□□□ -0.76
HCG18-241ENST00000602290 FBXW4P57775 412 aa10.33□□□□□ -0.76
HCG18-241ENST00000602290 BTG1P62324 171 aa10.33□□□□□ -0.76
HCG18-241ENST00000602290 BSPH1Q075Z2 132 aa10.33□□□□□ -0.76
HCG18-241ENST00000602290 FOXL1Q12952 345 aa10.33□□□□□ -0.76
HCG18-241ENST00000602290 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa10.33□□□□□ -0.76
HCG18-241ENST00000602290 TSTD2Q5T7W7 516 aa10.33□□□□□ -0.76
HCG18-241ENST00000602290 GPR139Q6DWJ6 353 aa10.33□□□□□ -0.76
HCG18-241ENST00000602290 TEX261Q6UWH6 196 aa10.33□□□□□ -0.76
HCG18-241ENST00000602290 RRM2BQ7LG56 351 aa10.33□□□□□ -0.76
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