RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533099.5

RNPC3-208, Transcript of RNA binding region (RNP1, RRM) containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene RNPC3, Length 3,641 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3-208ENST00000533099 CDNFQ49AH0 187 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 ZNF765Q7L2R6 523 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 VN1R4Q7Z5H5 301 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 BEST3Q8N1M1 668 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 SPERTQ8NA61 448 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 ACBD4Q8NC06 268 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 TMEM52Q8NDY8 209 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 OR51S1Q8NGJ8 323 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 OR4C3Q8NH37 302 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 ZPLD1Q8TCW7 415 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 SFXN5Q8TD22 340 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 HPF1Q9NWY4 346 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 TBX21Q9UL17 535 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 PTPRDP23468 1912 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 ATP1B1P05026 303 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 CD2P06729 351 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 C5AR1P21730 350 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 ACTA2P62736 377 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 ACTG2P63267 376 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 EOGTQ5NDL2 527 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 AGBL4Q5VU57 503 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 Q6ZSR6 202 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 MFSD9Q8NBP5 474 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 YIPF5Q969M3 257 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 SPACA5Q96QH8 159 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 HHIPQ96QV1 700 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 OR1F2PQ96R84 312 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 SERINC2Q96SA4 455 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 HRASLSQ9HDD0 168 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 SLC39A1Q9NY26 324 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 ADAM29Q9UKF5 820 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 NUP50Q9UKX7 468 aa7.56□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 VWA8A3KMH1 1905 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 A0A1B0GW55 424 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 SERTM1A2A2V5 107 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 H3BML4 177 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 THY1P04216 161 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 DUX4L2P0CJ85 424 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 DUX4L3P0CJ86 424 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 DUX4L4P0CJ87 422 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 DUX4L5P0CJ88 424 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 DUX4L6P0CJ89 424 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 DUX4L7P0CJ90 424 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 IGFBP4P22692 258 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 FOXL2P58012 376 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 HHEXQ03014 270 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 DUSP6Q16828 381 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 METTL11BQ5VVY1 283 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 CARD17Q5XLA6 110 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 MAMSTRQ6ZN01 415 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 GPAT4Q86UL3 456 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 PPP1R14AQ96A00 147 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 WDR34Q96EX3 536 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 AICDAQ9GZX7 198 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 TREM1Q9NP99 234 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 NRIP3Q9NQ35 241 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 DUX4Q9UBX2 424 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 SLC22A13Q9Y226 551 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 SIGLEC7Q9Y286 467 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 SLC16A7O60669 478 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 CTSBP07858 339 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 ZNF823P16415 610 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 CCR9P51686 369 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 DPTQ07507 201 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 MEP1BQ16820 701 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 PARM1Q6UWI2 310 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 LINC00346Q8IVM7 164 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 TEX19Q8NA77 164 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 ZNF248Q8NDW4 579 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 OR10AC1Q8NH08 325 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 ASB16Q96NS5 453 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 NUDT22Q9BRQ3 303 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 MED18Q9BUE0 208 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 GSX2Q9BZM3 304 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 VDAC3Q9Y277 283 aa7.55□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa7.54□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 C17orf51A8MQB3 221 aa7.54□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 C2orf74A8MZ97 194 aa7.54□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 H3BUI4 141 aa7.54□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 ZFPL1O95159 310 aa7.54□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 ADH1BP00325 375 aa7.54□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 PGAM2P15259 253 aa7.54□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 ENPP1P22413 925 aa7.54□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RNPC3-208ENST00000533099 CDK5R1Q15078 307 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms