RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511362.5

ATXN3-211, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 3

Gene ATXN3, Length 591 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-211ENST00000511362 MED13Q9UHV7 2174 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 FABP12A6NFH5 140 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 ANKDD1BA6NHY2 528 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 ARHGEF33A8MVX0 844 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF487B1APH4 448 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 TFECO14948 347 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 ARPC3O15145 178 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 SURF4O15260 269 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 MID1O15344 667 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 RNF13O43567 381 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 FCMRO60667 390 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 CLDN14O95500 239 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 PMS2P2O95744 297 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 IFNA4P05014 189 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 HMBSP08397 361 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 RBP1P09455 135 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 OR52Z1P0C646 297 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 SMIM10L1P0DMW3 83 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 UGT1A6P19224 532 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 NR1D1P20393 614 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 UGT1A1P22309 533 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 ME2P23368 584 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 DNASE1P24855 282 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 PTGER4P35408 488 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 AHRP35869 848 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 FDFT1P37268 417 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 PIGAP37287 484 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 CEACAM6P40199 344 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 CCR2P41597 374 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 MATKP42679 507 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 MAGEA6P43360 314 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 NSFP46459 744 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 YAP1P46937 504 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 OR3A3P47888 321 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 RAB28P51157 221 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 CLCN3P51790 818 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM33P57088 247 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 BRWD1-AS2P59051 145 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF45Q02386 682 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 ST3GAL1Q11201 340 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 PDE7AQ13946 482 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 TRAM2Q15035 370 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 TAZQ16635 292 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 GSTA3Q16772 222 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 GUK1Q16774 197 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 IMPG1Q17R60 797 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 QRICH1Q2TAL8 776 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 UGT3A2Q3SY77 523 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 LIN52Q52LA3 116 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 CBWD5Q5RIA9 395 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 C6orf136Q5SQH8 315 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 SEL1L3Q68CR1 1132 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 TIGD3Q6B0B8 471 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 CYB5R2Q6BCY4 276 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 SLC27A1Q6PCB7 646 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 BRAT1Q6PJG6 821 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 LRRN1Q6UXK5 716 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 GDPD3Q7L5L3 318 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 ARCQ7LC44 396 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 PRSS42Q7Z5A4 293 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 NT5DC3Q86UY8 548 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 AACSQ86V21 672 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM17Q86X19 198 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF561Q8N587 486 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 UXS1Q8NBZ7 420 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 DNAAF1Q8NEP3 725 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM185AQ8NFB2 350 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 STXBP6Q8NFX7 210 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 OR52H1Q8NGJ2 320 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 OR5M8Q8NGP6 311 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 GRPEL2Q8TAA5 225 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 OLIG1Q8TAK6 271 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 FAM222BQ8WU58 562 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 CHPT1Q8WUD6 406 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 NAT14Q8WUY8 206 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 SMPDL3BQ92485 455 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 AP3S1Q92572 193 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 GTF2H4Q92759 462 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 UFD1Q92890 307 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 S100PBPQ96BU1 408 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 RNF183Q96D59 192 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 FBXO17Q96EF6 278 aa2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
ATXN3-211ENST00000511362 C16orf58Q96GQ5 468 aa2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.4 ms