RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516230.1

RNU6-287P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 287, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-287P, Length 98 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-287P-201ENST00000516230 HES5Q5TA89 166 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 LRRC38Q5VT99 294 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 LIPNQ5VXI9 398 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 STUMQ69YW2 141 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 KRT80Q6KB66 452 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRMT9Q6P2P2 845 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 SPATA8Q6RVD6 105 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 STRADAQ7RTN6 431 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 GID4Q8IVV7 300 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 LRRC43Q8N309 656 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 DNAAF3Q8N9W5 541 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 IQUBQ8NA54 791 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR2G3Q8NGZ4 309 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 COQ8AQ8NI60 647 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 GPR119Q8TDV5 335 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 PAQR8Q8TEZ7 354 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 P3H4Q92791 437 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 TM4SF18Q96CE8 201 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 CYP2S1Q96SQ9 504 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 TBL1YQ9BQ87 522 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 NLNQ9BYT8 704 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 DEFB127Q9H1M4 99 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 DUSP21Q9H596 190 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 VCPKMTQ9H867 229 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 EDA2RQ9HAV5 297 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 CTPS2Q9NRF8 586 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 B3GNT2Q9NY97 397 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 GALPQ9UBC7 116 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 CLCF1Q9UBD9 225 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 GHRLQ9UBU3 117 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 CDH7Q9ULB5 785 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 USP16Q9Y5T5 823 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 R4GN34 69 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 NBASA2RRP1 2371 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 WDR62O43379 1518 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 ANK2Q01484 3957 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 H3BMH7 237 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 FCN1O00602 326 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 CTAG2O75638 210 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 CNMDO75829 334 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 STK17BO94768 372 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 YIF1AO95070 293 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 PGM3O95394 542 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 HLA-DQB1P01920 261 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 RLN1P04808 185 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 SERPINF2P08697 491 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM58BPP0C7Q3 252 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 SMIM10L1P0DMW3 83 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 BCKDHAP12694 445 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 POU2F1P14859 743 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 ABOP16442 354 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 CASTP20810 708 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 CXCR2P25025 360 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 MAGEA6P43360 314 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 IDH2P48735 452 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 CDH4P55283 916 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 BIDP55957 195 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 ARG2P78540 354 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 C2orf54Q08AI8 447 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 HYAL4Q2M3T9 481 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF699Q32M78 642 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 TTLL9Q3SXZ7 439 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 EPC2Q52LR7 807 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 SMUG1Q53HV7 270 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM222AQ5U5X8 452 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR2A2Q6IF42 318 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 GUSBP11Q6P575 273 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 LEG1Q6P5S2 330 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 MIER3Q7Z3K6 550 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM126BQ8IUX1 230 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 SVOPLQ8N434 492 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR4K5Q8NGD3 323 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR1N2Q8NGR9 330 aa-0.43□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms