RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364043.1

SNORD46-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 46, humanhuman

BASIC

Gene SNORD46, Length 104 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD46-201ENST00000364043 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 KLHL25Q9H0H3 589 aa7.04□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 ARMC7Q9H6L4 198 aa7.04□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 ANKRA2Q9H9E1 313 aa7.04□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 SIAEQ9HAT2 523 aa7.04□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 FAM60AQ9NP50 221 aa7.04□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 ISYNA1Q9NPH2 558 aa7.04□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 KLHL1Q9NR64 748 aa7.04□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 C14orf105Q9NVL8 296 aa7.04□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 TBCCD1Q9NVR7 557 aa7.04□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 IL20Q9NYY1 176 aa7.04□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 A0A1B0GTH9 108 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 A0A1W2PPR1 153 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 FITM1A5D6W6 292 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 ZNF860A6NHJ4 632 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 METTL15A6NJ78 407 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 A8MV72 311 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 M0R129 80 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 CCRL2O00421 344 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 PRODHO43272 600 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 CHST10O43529 356 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 FCMRO60667 390 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 LDB3O75112 727 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 CBX7O95931 251 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 HRGP04196 525 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 SCG5P05408 212 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 CELA2AP08217 269 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 COX6A1P12074 109 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 CD46P15529 392 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 TNNI3P19429 210 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 NR4A1P22736 598 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 GADD45AP24522 165 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 OPRL1P41146 370 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 RGS6P49758 472 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 NCS1P62166 190 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 GINS1Q14691 196 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 POU4F3Q15319 338 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 SYT16Q17RD7 645 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 MINDY4Q4G0A6 757 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 KLHL22Q53GT1 634 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 SYT14P1Q58G82 188 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 TCTE1Q5JU00 501 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 ACSM5Q6NUN0 579 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 TUBA3EQ6PEY2 450 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 Q6ZNX1 250 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 RRM2BQ7LG56 351 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 ADCK1Q86TW2 530 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 OR4N5Q8IXE1 308 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 SLC43A2Q8N370 569 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 CLIP4Q8N3C7 705 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 SLC15A4Q8N697 577 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 AMER2Q8N7J2 671 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 TCEANCQ8N8B7 351 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 POGLUT1Q8NBL1 392 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 C7orf57Q8NEG2 295 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 OR5M3Q8NGP4 307 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 TMEM163Q8TC26 289 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 SLC38A2Q96QD8 506 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 IL4I1Q96RQ9 567 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 MGLLQ99685 303 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 GPA33Q99795 319 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 CRB3Q9BUF7 120 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 MND1Q9BWT6 205 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 TSSK6Q9BXA6 273 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 TEX12Q9BXU0 123 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 DCSTAMPQ9H295 470 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 MMP27Q9H306 513 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 AMBNQ9NP70 447 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 ADAP2Q9NPF8 381 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 B4GALT7Q9UBV7 327 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 PLCL2Q9UPR0 1127 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 ERGIC3Q9Y282 383 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 TMEM5Q9Y2B1 443 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD46-201ENST00000364043 A0A1B0GX78 115 aa7.02□□□□□ -1.29
SNORD46-201ENST00000364043 TMEM129A0AVI4 362 aa7.02□□□□□ -1.29
SNORD46-201ENST00000364043 CDHR4A6H8M9 788 aa7.02□□□□□ -1.29
SNORD46-201ENST00000364043 ANKRD33BA6NCL7 494 aa7.02□□□□□ -1.29
SNORD46-201ENST00000364043 TUBAL3A6NHL2 446 aa7.02□□□□□ -1.29
SNORD46-201ENST00000364043 VSTM2BA6NLU5 285 aa7.02□□□□□ -1.29
SNORD46-201ENST00000364043 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.9 ms