RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529957.5

GNPTG-208, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, human

TSL 5

Gene GNPTG, Length 922 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNPTG-208	ENST00000529957	GRAP	Q13588	217 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GNPTG-208	ENST00000529957	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
GNPTG-208	ENST00000529957	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
GNPTG-208	ENST00000529957	FAM89A	Q96GI7	184 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GNPTG-208	ENST00000529957	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
GNPTG-208	ENST00000529957	CXCL9	Q07325	125 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GNPTG-208	ENST00000529957	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
GNPTG-208	ENST00000529957	MPND	Q8N594	471 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GNPTG-208	ENST00000529957	VPS33B	Q9H267	617 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GNPTG-208	ENST00000529957	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		28.65	■■■□□ 2.18
GNPTG-208	ENST00000529957	TNS4	Q8IZW8	715 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GNPTG-208	ENST00000529957	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GNPTG-208	ENST00000529957	HYPK	Q9NX55	129 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GNPTG-208	ENST00000529957	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GNPTG-208	ENST00000529957	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
GNPTG-208	ENST00000529957	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GNPTG-208	ENST00000529957	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GNPTG-208	ENST00000529957	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
GNPTG-208	ENST00000529957	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
GNPTG-208	ENST00000529957	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
GNPTG-208	ENST00000529957	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
GNPTG-208	ENST00000529957	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
GNPTG-208	ENST00000529957	IFT57	Q9NWB7	429 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GNPTG-208	ENST00000529957	RASSF10	A6NK89	507 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GNPTG-208	ENST00000529957	YDJC	A8MPS7	323 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GNPTG-208	ENST00000529957	FOXN1	O15353	648 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GNPTG-208	ENST00000529957	TRAF5	O00463	557 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GNPTG-208	ENST00000529957	RAD17	O75943	681 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GNPTG-208	ENST00000529957	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
GNPTG-208	ENST00000529957	CCDC184	Q52MB2	194 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GNPTG-208	ENST00000529957	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GNPTG-208	ENST00000529957	CAPN15	O75808	1086 aa		28.58	■■■□□ 2.17
GNPTG-208	ENST00000529957	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
GNPTG-208	ENST00000529957	GNAI1	P63096	354 aa		28.57	■■■□□ 2.16
GNPTG-208	ENST00000529957	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		28.57	■■■□□ 2.16
GNPTG-208	ENST00000529957	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		28.57	■■■□□ 2.16
GNPTG-208	ENST00000529957	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
GNPTG-208	ENST00000529957	SHTN1	A0MZ66	631 aa		28.56	■■■□□ 2.16
GNPTG-208	ENST00000529957	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16
GNPTG-208	ENST00000529957	CST9	Q5W186	159 aa		28.56	■■■□□ 2.16
GNPTG-208	ENST00000529957	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		28.56	■■■□□ 2.16
GNPTG-208	ENST00000529957	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
GNPTG-208	ENST00000529957	TMC4	Q7Z404	712 aa		28.55	■■■□□ 2.16
GNPTG-208	ENST00000529957	GPSM2	P81274	684 aa		28.54	■■■□□ 2.16
GNPTG-208	ENST00000529957	POLL	Q9UGP5	575 aa		28.54	■■■□□ 2.16
GNPTG-208	ENST00000529957	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	28.54	■■■□□ 2.16
GNPTG-208	ENST00000529957	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	28.53	■■■□□ 2.16
GNPTG-208	ENST00000529957	GOLGA2	Q08379	1002 aa		28.53	■■■□□ 2.16
GNPTG-208	ENST00000529957	TSPYL6	Q8N831	410 aa		28.53	■■■□□ 2.16
GNPTG-208	ENST00000529957	MYD88	Q99836	296 aa		28.53	■■■□□ 2.16
GNPTG-208	ENST00000529957	WBP1L	Q9NX94	342 aa		28.53	■■■□□ 2.16
GNPTG-208	ENST00000529957	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	28.52	■■■□□ 2.16
GNPTG-208	ENST00000529957	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	28.52	■■■□□ 2.16
GNPTG-208	ENST00000529957	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	28.52	■■■□□ 2.16
GNPTG-208	ENST00000529957	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	28.51	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		28.51	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	28.51	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		28.51	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		28.51	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		28.51	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	SCN9A	Q15858	1988 aa		28.51	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	28.5	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	RIMBP2	O15034	1052 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	TNIP1	Q15025	636 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	WASHC4	Q2M389	1173 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	28.5	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	28.49	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	28.49	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		28.49	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		28.49	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		28.48	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	28.48	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	28.48	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		28.47	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	C6orf229	H3BNL8	230 aa		28.47	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	PSMD14	O00487	310 aa		28.47	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	DOK7	Q18PE1	504 aa		28.46	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		28.46	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	MICALL2	Q8IY33	904 aa		28.46	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		28.46	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		28.46	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	AIDA	Q96BJ3	306 aa		28.46	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	28.46	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		28.46	■■■□□ 2.15
GNPTG-208	ENST00000529957	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	28.45	■■■□□ 2.14
GNPTG-208	ENST00000529957	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	28.45	■■■□□ 2.14
GNPTG-208	ENST00000529957	CAPNS2	Q96L46	248 aa		28.45	■■■□□ 2.14
GNPTG-208	ENST00000529957	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	28.45	■■■□□ 2.14
GNPTG-208	ENST00000529957	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		28.45	■■■□□ 2.14
GNPTG-208	ENST00000529957	RTL9	Q8NET4	1388 aa		28.45	■■■□□ 2.14
GNPTG-208	ENST00000529957	LBX1	P52954	281 aa		28.44	■■■□□ 2.14
GNPTG-208	ENST00000529957	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		28.44	■■■□□ 2.14
GNPTG-208	ENST00000529957	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	28.44	■■■□□ 2.14
GNPTG-208	ENST00000529957	ECE2	O60344	883 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GNPTG-208	ENST00000529957	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	28.43	■■■□□ 2.14
GNPTG-208	ENST00000529957	EGFR	P00533	1210 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GNPTG-208	ENST00000529957	DLK2	Q6UY11	383 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GNPTG-208	ENST00000529957	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	28.43	■■■□□ 2.14
GNPTG-208	ENST00000529957	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GNPTG-208	ENST00000529957	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		28.43	■■■□□ 2.14

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