RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549		A0A1W2PNV4	684 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	MSTN	O14793	375 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	FMO6P	O60774	539 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	TNFSF13	O75888	250 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	GKN3P	P0CG01	181 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	SHC1	P29353	583 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	TACR3	P29371	465 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	LUZP2	Q86TE4	346 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	OR2T12	Q8NG77	320 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	RNF128	Q8TEB7	428 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	OR5B2	Q96R09	309 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	ENO4	A6NNW6	628 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	SULT2B1	O00204	365 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	TPST1	O60507	370 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	AQP8	O94778	261 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	LGI1	O95970	557 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	CD8B	P10966	210 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	CXCR1	P25024	350 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	AQP1	P29972	269 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	KCNJ5	P48544	419 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	DIO1	P49895	249 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	NUDT2	P50583	147 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	MNAT1	P51948	309 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	NCALD	P61601	193 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	DMTN	Q08495	405 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	PDK3	Q15120	406 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	KIF18B	Q86Y91	864 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	CADM2	Q8N3J6	435 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	LINC01560	Q8TB33	94 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	STK35	Q8TDR2	534 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	NRGN	Q92686	78 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	STARD4	Q96DR4	205 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	CMTM6	Q9NX76	183 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	NDE1	Q9NXR1	346 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	BAG5	Q9UL15	447 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549		A0A1W2PNR3	127 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549		A8MVM7	634 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549		A8MXE2	369 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	CYTIP	O60759	359 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	CTAG2	O75638	210 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	PRKD3	O94806	890 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	TFPI	P10646	304 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	PNMT	P11086	282 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	PRG2	P13727	222 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	ENPP1	P22413	925 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	CTBP2	P56545	445 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	SIRPA	P78324	504 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	SLC35A1	P78382	337 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	SORD	Q00796	357 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	KRT72	Q14CN4	511 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	NRF1	Q16656	503 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	DUSP7	Q16829	419 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	VWA1	Q6PCB0	445 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	ULK3	Q6PHR2	472 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	FCRLA	Q7L513	359 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	MICU2	Q8IYU8	434 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	C3orf49	Q96BT1	292 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	TAMM41	Q96BW9	452 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	ARHGDIG	Q99819	225 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	BCO1	Q9HAY6	547 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		11	□□□□□ -0.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms