RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP-0.11□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TTC26A0AVF1 554 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VSTM2BA6NLU5 285 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 H3BMQ9 156 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CASKO14936 926 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ALOX15BO15296 676 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 APRTP07741 180 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IFI30P13284 250 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF30P17039 623 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IFNAR1P17181 557 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VCLP18206 1134 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP6V1B2P21281 511 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CXCR2P25025 360 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ASMTP46597 345 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GNPDA1P46926 289 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HTR5AP47898 357 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GDI2P50395 445 aaKnown RBP-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EMDP50402 254 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CASP9P55211 416 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DLX1P56177 255 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HMGCS1Q01581 520 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SRYQ05066 204 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC10A7Q0GE19 358 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLD1Q13393 1074 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTK6Q13882 451 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LAGE3Q14657 143 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PARP6Q2NL67 630 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF789Q5FWF6 425 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LIPNQ5VXI9 398 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SAXO2Q658L1 398 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR8G2PQ6IF36 304 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KDM7AQ6ZMT4 941 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GBP6Q6ZN66 633 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRSS42Q7Z5A4 293 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRIM69Q86WT6 500 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RDH10Q8IZV5 341 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRRC52Q8N7C0 313 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LSMEM1Q8N8F7 131 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NAT8LQ8N9F0 302 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCNYQ8ND76 341 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR4F15Q8NGB8 312 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TEKT1Q969V4 418 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC25A36Q96CQ1 311 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NDUFAF3Q9BU61 184 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CACNG6Q9BXT2 260 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHMP4AQ9BY43 222 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VCPKMTQ9H867 229 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PFDN4Q9NQP4 134 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNRD1Q9P1U0 126 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF337Q9Y3M9 751 aa-0.12□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTPRTO14522 1441 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM223A0PJW6 202 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC69A6NI79 296 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 INS-IGF2F8WCM5 200 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ECI2O75521 394 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HSPA4LO95757 839 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCNE2O96020 404 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IL4P05112 153 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC35G4P0C7Q5 338 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BCKDHAP12694 445 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SERPINA2P20848 420 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CNR1P21554 472 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OMGP23515 440 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC11A1P49279 550 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RBX1P62877 108 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DEFB103AP81534 67 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPP2Q13103 211 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CUL1Q13616 776 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PARP10Q53GL7 1025 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BOLA3Q53S33 107 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MFSD4BQ5TF39 518 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C11orf71Q6IPW1 123 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WDR59Q6PJI9 974 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM136Q6ZRR5 245 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PAQR9Q6ZVX9 377 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 P4HA3Q7Z4N8 544 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PAQR7Q86WK9 346 aa-0.13□□□□□ -2.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CNTN4Q8IWV2 1026 aa-0.13□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms