RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437028.5

SNHG11-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 11, human

TSL 3

Gene SNHG11, Length 1,169 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG11-208	ENST00000437028	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	PLAU	P00749	431 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	GSN	P06396	782 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	PRKCA	P17252	672 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	PRDX6	P30041	224 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	FUT5	Q11128	374 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	CBFB	Q13951	182 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	NFYC	Q13952	458 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	CBLN3	Q6UW01	205 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF614	Q8N883	585 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	DUXA	A6NLW8	204 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	MRAS	O14807	208 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	CLOCK	O15516	846 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF264	O43296	627 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	AK1	P00568	194 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	NPIPA8	P0DM63	369 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	UBL4A	P11441	157 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	NID1	P14543	1247 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	SHC1	P29353	583 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	CASP9	P55211	416 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	RAC3	P60763	192 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	ITGAD	Q13349	1161 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	GTDC1	Q4AE62	458 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	REP15	Q6BDI9	236 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	OR5W2	Q8NH69	310 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	GPR119	Q8TDV5	335 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	GTF2H4	Q92759	462 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	ROS1	P08922	2347 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028		A0A096LPI6	279 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	INAFM1	C9JVW0	142 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	AIM2	O14862	343 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	ADA	P00813	363 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	UQCRC2	P22695	453 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	IDUA	P35475	653 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	CCR4	P51679	360 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	KRT72	Q14CN4	511 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	TAB1	Q15750	504 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	COQ5	Q5HYK3	327 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028		Q6ZT83	130 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	RCN3	Q96D15	328 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	OR7D2	Q96RA2	312 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	BCO1	Q9HAY6	547 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	GID8	Q9NWU2	228 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	JMJD1C	Q15652	2540 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	FBP2	O00757	339 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	EFNA2	O43921	213 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	NTN1	O95631	604 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	ENPP1	P22413	925 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	MXRA7	P84157	204 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	VEZF1	Q14119	521 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	QPRT	Q15274	297 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	13.69	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	SAXO2	Q658L1	398 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	RETREG3	Q86VR2	466 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM234	Q8WY98	164 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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