RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-208ENST00000574234 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 SSX8Q7RTT4 187 aa4.5□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 IFNEQ86WN2 208 aa4.5□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 C9orf40Q8IXQ3 194 aa4.5□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa4.5□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 LMNTD2Q8IXW0 634 aa4.5□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 MUC15Q8N387 334 aa4.5□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 SVOPLQ8N434 492 aa4.5□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 ZDHHC22Q8N966 263 aa4.5□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 MLKLQ8NB16 471 aa4.5□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 SYT14Q8NB59 555 aa4.5□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 STEAP2Q8NFT2 490 aa4.5□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 ABHD11Q8NFV4 315 aa4.5□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 OR1J4Q8NGS1 313 aa4.5□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 OR6K3Q8NGY3 331 aa4.5□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 TMEM170AQ8WVE7 144 aa4.5□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 KRT35Q92764 455 aa4.5□□□□□ -1.69
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TRIM25-208ENST00000574234 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 ALS2CR12Q96Q35 445 aa4.5□□□□□ -1.69
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TRIM25-208ENST00000574234 P2RY12Q9H244 342 aa4.5□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 ESM1Q9NQ30 184 aa4.5□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 GRHL1Q9NZI5 618 aa4.5□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa4.5□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa4.5□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 LCMT1Q9UIC8 334 aa4.5□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
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TRIM25-208ENST00000574234 ZNF175Q9Y473 711 aa4.5□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.49□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 A4D1N5 150 aa4.49□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 DPRXA6NFQ7 191 aa4.49□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 C17orf105B2RV13 164 aa4.49□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 M0QZ24 198 aa4.49□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 CTNSO60931 367 aa4.49□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 CBR3O75828 277 aa4.49□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 PROSCO94903 275 aa4.49□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 LRATO95237 230 aa4.49□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 IFNA16P05015 189 aa4.49□□□□□ -1.69
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TRIM25-208ENST00000574234 IL7RP16871 459 aa4.49□□□□□ -1.69
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TRIM25-208ENST00000574234 AHRP35869 848 aa4.49□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 CASP3P42574 277 aa4.49□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 VPS41P49754 854 aa4.49□□□□□ -1.69
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TRIM25-208ENST00000574234 C21orf58P58505 322 aa4.49□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 TBPL1P62380 186 aa4.49□□□□□ -1.69
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TRIM25-208ENST00000574234 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
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TRIM25-208ENST00000574234 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa4.49□□□□□ -1.69
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TRIM25-208ENST00000574234 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
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TRIM25-208ENST00000574234 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 RABL3Q5HYI8 236 aa4.49□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 ACSM2BQ68CK6 577 aa4.49□□□□□ -1.69
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TRIM25-208ENST00000574234 AFTPHQ6ULP2 937 aa4.49□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 CHMP1BQ7LBR1 199 aa4.49□□□□□ -1.69
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TRIM25-208ENST00000574234 ZNF347Q96SE7 839 aa4.49□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 DHRS9Q9BPW9 319 aa4.49□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 TBL1YQ9BQ87 522 aa4.49□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 BPESC1Q9GZL8 116 aa4.49□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 RHBGQ9H310 441 aa4.49□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 NTN4Q9HB63 628 aa4.49□□□□□ -1.69
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