RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 GRHPRQ9UBQ7 328 aa11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 PLCL2Q9UPR0 1127 aa11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 MIA3Q5JRA6 1907 aa11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 FITM1A5D6W6 292 aa11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC22A31A6NKX4 558 aa11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 RNF13O43567 381 aa11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 GABRA5P31644 462 aa11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 IRS1P35568 1242 aa11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF79Q15937 498 aa11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 OR7E24Q6IFN5 339 aa11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 RASD2Q96D21 266 aa11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 PSD2Q9BQI7 771 aa11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC16A5O15375 505 aa11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 SELENOFO60613 162 aa11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 DCNP07585 359 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 CRYBB2P43320 205 aa11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 RAE1P78406 368 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 OPCMLQ14982 345 aa11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC6A19Q695T7 634 aa11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM198BQ6UWH4 519 aa11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 DPY19L4Q7Z388 723 aa11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 OR51D1Q8NGF3 324 aa11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 GPA33Q99795 319 aa11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 PLEKHA1Q9HB21 404 aa11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 CREBZFQ9NS37 354 aa11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 CDH23Q9H251 3354 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 TRABD2BA6NFA1 517 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 HTR3BO95264 441 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF823P16415 610 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 CEBPBP17676 345 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 CXCR1P25024 350 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 HTR4Q13639 388 aa11.5□□□□□ -0.57
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TRIOBP-211ENST00000492485 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 QSOX2Q6ZRP7 698 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 ATCAYQ86WG3 371 aa11.5□□□□□ -0.57
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TRIOBP-211ENST00000492485 OR4D9Q8NGE8 314 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 OR52I2Q8NH67 350 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 CCL4L1Q8NHW4 92 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 DTD2Q96FN9 168 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 EDARQ9UNE0 448 aa11.5□□□□□ -0.57
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TRIOBP-211ENST00000492485 A0A1W2PR48 441 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 C1orf226A1L170 272 aa11.5□□□□□ -0.57
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TRIOBP-211ENST00000492485 F3P13726 295 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 PBX2P40425 430 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 OR3A2P47893 321 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 PRLHRP49683 370 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 GPR50Q13585 617 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 OR1Q1Q15612 314 aa11.5□□□□□ -0.57
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TRIOBP-211ENST00000492485 SSX6Q7RTT6 188 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 GJD3Q8N144 294 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 ARRDC3Q96B67 414 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
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TRIOBP-211ENST00000492485 ACOXLQ9NUZ1 547 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 GPATCH2Q9NW75 528 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 ERVK-19Q9WJR5 959 aa11.5□□□□□ -0.57
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TRIOBP-211ENST00000492485 UBR3Q6ZT12 1888 aa11.5□□□□□ -0.57
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TRIOBP-211ENST00000492485 EPHA5P54756 1037 aa11.5□□□□□ -0.57
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TRIOBP-211ENST00000492485 EIPR1Q53HC9 387 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 C1orf189Q5VU69 101 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 GLT8D1Q68CQ7 371 aa11.5□□□□□ -0.57
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TRIOBP-211ENST00000492485 ASPGQ86U10 573 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 BATF2Q8N1L9 274 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 SIRT6Q8N6T7 355 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 PLPP7Q8NBV4 271 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 CD300LFQ8TDQ1 290 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 PCBD2Q9H0N5 130 aa11.5□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 H3BML4 177 aa11.49□□□□□ -0.57
TRIOBP-211ENST00000492485 FZD6O60353 706 aa11.49□□□□□ -0.57
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