RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258796.11

TTYH3-201, Transcript of tweety family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTYH3, Length 4,840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTYH3-201ENST00000258796 MPIG6BO95866 241 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 SPNP16150 400 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 PXDC1Q5TGL8 231 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 CD276Q5ZPR3 534 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 FAM71E1Q6IPT2 247 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 STEAP2Q8NFT2 490 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 OR4C15Q8NGM1 316 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 INTS14Q96SY0 518 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 PITX2Q99697 317 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 SLC46A2Q9BY10 475 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 PLSCR3Q9NRY6 295 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 HEPACAM2A8MVW5 462 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 SYT7O43581 403 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 CR2P20023 1033 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 OPRD1P41143 372 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 KIAA1024LP59773 190 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 CCINQ13939 588 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 CASD1Q96PB1 797 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 ZNF304Q9HCX3 659 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 C2orf42Q9NWW7 574 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 SERTAD3Q9UJW9 196 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 EVPLQ92817 2033 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 SRP9P49458 86 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 TAS2R19P59542 299 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 UBA52P62987 128 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 IRF4Q15306 451 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 ZNF542PQ5EBM4 170 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 SVBPQ8N300 66 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 SCGB1C1Q8TD33 95 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 NDUFB11Q9NX14 153 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 CAMK2AQ9UQM7 478 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 BCORQ6W2J9 1755 aa18.39■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 KCNJ13O60928 360 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 GPR50Q13585 617 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 PNPLA2Q96AD5 504 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 WASH6PQ9NQA3 447 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 ZNF226Q9NYT6 803 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 ADAM29Q9UKF5 820 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 OR5K4A6NMS3 321 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 ZAR1LA6NP61 321 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 A8MVJ9 347 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 IGLV3-25P01717 112 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 ARF1P84077 181 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 CRMP1Q14194 572 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 IL17RDQ8NFM7 739 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 OR10K1Q8NGX5 313 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 KLHDC7BQ96G42 594 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 SLC22A12Q96S37 553 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 FN3KQ9H479 309 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 NRIP3Q9NQ35 241 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 SNAPINO95295 136 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 PNMTP11086 282 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 FAHD1Q6P587 224 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 TMEM156Q8N614 296 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 TSTD1Q8NFU3 115 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 OR2A12Q8NGT7 310 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 TGM6O95932 706 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 OR8G3PP0DMU2 310 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 GAAP10253 952 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 CD300CQ08708 224 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 BPIFB2Q8N4F0 458 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 GLIPR2Q9H4G4 154 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 ACTR10Q9NZ32 417 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 PGAP2Q9UHJ9 254 aa18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP18.37■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 NPPBP16860 134 aa18.37■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 CCNOP22674 350 aa18.37■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP18.37■□□□□ 0.531e-6■■□□□ 12.3
TTYH3-201ENST00000258796 TGM4P49221 684 aa18.37■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 DSC1Q08554 894 aa18.37■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 TM4SF18Q96CE8 201 aa18.37■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 DOK1Q99704 481 aa18.37■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 HS3ST2Q9Y278 367 aa18.37■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 ELK1P19419 428 aa18.37■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 GZMKP49863 264 aa18.37■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 CDK3Q00526 305 aa18.37■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 MEF2DQ14814 521 aa18.37■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 BAK1Q16611 211 aa18.37■□□□□ 0.53
TTYH3-201ENST00000258796 FAM26EQ8N5C1 309 aa18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms