RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258243.6

URB2-201, Transcript of URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene URB2, Length 5,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB2-201ENST00000258243 ADAM19Q9H013 955 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 TM7SF3Q9NS93 570 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 PAHP00439 452 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 HRGP04196 525 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 ETFAP13804 333 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 GCH1P30793 250 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 SSR4P51571 173 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 REEP5Q00765 189 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 CDK5R2Q13319 367 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 OR8S1Q8NH09 359 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 ASB11Q8WXH4 323 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 SMIM14Q96QK8 99 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 CTRCQ99895 268 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 OR11A1Q9GZK7 315 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 NIT2Q9NQR4 276 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 SDHBP21912 280 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 HTR6P50406 440 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 GPR18Q14330 331 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 SPHARQ15513 63 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 STK11Q15831 433 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 SAMD12Q8N8I0 201 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 FN3KQ9H479 309 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 ZNF286AQ9HBT8 521 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 FGF21Q9NSA1 209 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 RXFP3Q9NSD7 469 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 PHYHO14832 338 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 NDUFV2P19404 249 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 CELP19835 753 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 ADRA1AP35348 466 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 GAS6Q14393 721 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 LETMD1Q6P1Q0 360 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 IL20RBQ6UXL0 311 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 DTWD1Q8N5C7 304 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 NEIL3Q8TAT5 605 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 CPT1CQ8TCG5 803 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 ST7LQ8TDW4 575 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 RAB39BQ96DA2 213 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 C2orf42Q9NWW7 574 aa10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 TGFBR3Q03167 851 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 PAGE3Q5JUK9 113 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 TEX26Q8N6G2 289 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 TMEM178AQ8NBL3 297 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 OR51G2Q8NGK0 314 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 TMEM41AQ96HV5 264 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 PRRX2Q99811 253 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 NGBQ9NPG2 151 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 CBLCQ9ULV8 474 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 DFFBO76075 338 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 TOXO94900 526 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 SFTPBP07988 381 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 STAG3L2P0CL84 134 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 GCGRP47871 477 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 DAP3P51398 398 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 RIDAP52758 137 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 ERV3-1Q14264 604 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 TMEM151AQ8N4L1 468 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 ANKRD53Q8N9V6 530 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 NPRL2Q8WTW4 380 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 MSLNLQ96KJ4 702 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 TTTY10Q9BZA0 68 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 CD79AP11912 226 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 DCTP40126 519 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 ZP2Q05996 745 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 SPCS2Q15005 226 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 GLT8D1Q68CQ7 371 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 KIAA1211LQ6NV74 962 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 LILRA2Q8N149 483 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 SFXN5Q8TD22 340 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 MED30Q96HR3 178 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 NLKQ9UBE8 527 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 BTNL2Q9UIR0 455 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 DHDHQ9UQ10 334 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 PPP1R2P9O14990 202 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 EDIL3O43854 480 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 GPR75O95800 540 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 H2AFB2P0C5Z0 115 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 G0S2P27469 103 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 PRKXP51817 358 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 MLC1Q15049 377 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 FAM180BQ6P0A1 224 aa10.18□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 ADIPOR2Q86V24 386 aa10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.5 ms