RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	DNAJC13	O75165	2243 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193		A0A0J9YY10	115 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193		H3BML4	177 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	SLC22A5	O76082	557 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	LIPC	P11150	499 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	TEAD1	P28347	426 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	GRK5	P34947	590 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	IRS1	P35568	1242 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	B4GALNT1	Q00973	533 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ELP4	Q96EB1	424 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	PITX2	Q99697	317 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	UBQLN3	Q9H347	655 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193		V9GY05	133 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	PRRT4	C9JH25	899 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	FZD7	O75084	574 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	BCL6	P41182	706 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	BTBD2	Q9BX70	525 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	IL21	Q9HBE4	155 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	SPDEF	O95238	335 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	RAB3D	O95716	219 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ITGB8	P26012	769 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	RABIF	P47224	123 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	LSS	P48449	732 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	GXYLT1	Q4G148	440 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	COMMD7	Q86VX2	200 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	SAMD11	Q96NU1	681 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	NT5DC2	Q9H857	520 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	HHATL	Q9HCP6	504 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ASB6	Q9NWX5	421 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	VDAC3	Q9Y277	283 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	TEX46	H3BTG2	121 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193		H7C2Y5	167 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193		M0R036	132 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ACOT7	O00154	380 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	NPC1	O15118	1278 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	LILRB3	O75022	631 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	NR2C1	P13056	603 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ETV5	P41161	510 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	TGM4	P49221	684 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ETV1	P50549	477 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ACTB	P60709	375 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	VAMP2	P63027	116 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ACTG1	P63261	375 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	USP51	Q70EK9	711 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	LACC1	Q8IV20	430 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	EID2B	Q96D98	161 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	OR1F2P	Q96R84	312 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193		A0A0G2JMP0	313 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM72	A0PK05	275 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	CDHR4	A6H8M9	788 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	LRIT2	A6NDA9	550 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		7.5	□□□□□ -1.21

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