RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 HOXC5Q00444 222 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 FLOT2Q14254 428 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 FGFBP1Q14512 234 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 GANABQ14697 944 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 UGT3A2Q3SY77 523 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 LIN52Q52LA3 116 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 STX19Q8N4C7 294 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 METTL25Q8N6Q8 603 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 PROKR2Q8NFJ6 384 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 OR52N2Q8NGI0 321 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 CDRT15Q96T59 188 aa4.06□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 FBXO34Q9NWN3 711 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 PLEK2Q9NYT0 353 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJB11Q9UBS4 358 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 GLS2Q9UI32 602 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 HAO1Q9UJM8 370 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 U3KQV3 271 aa4.06□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 XIRP2A4UGR9 3374 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 GXYLT2A0PJZ3 443 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ELOVL7A1L3X0 281 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SERINC4A6NH21 518 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 RIIAD1A6NNX1 92 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 AHRRA9YTQ3 701 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SURF4O15260 269 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 CDC14BO60729 498 aa4.06□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 PRKD3O94806 890 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 IFNA2P01563 188 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 GGT1P19440 569 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 CHMP24386 653 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 FAM219BQ5XKK7 198 aa4.06□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 ELP4Q96EB1 424 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 NSL1Q96IY1 281 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SLC38A2Q96QD8 506 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 HCAR1Q9BXC0 346 aa4.06□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 GLIPR2Q9H4G4 154 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 TOR4AQ9NXH8 423 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 FAM96BQ9Y3D0 163 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ST14Q9Y5Y6 855 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa4.06□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 H6PDO95479 791 aa4.06□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 PTHP01270 115 aa4.06□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 PRG2P13727 222 aa4.06□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 KRT80Q6KB66 452 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SLC2A7Q6PXP3 512 aa4.06□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 ABHD5Q8WTS1 349 aa4.06□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 KCNK17Q96T54 332 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 NPAS2Q99743 824 aa4.06□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 SH2B3Q9UQQ2 575 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 TMED7Q9Y3B3 224 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 TESMINQ9Y4I5 508 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GTL3 188 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 CLCA1A8K7I4 914 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 OR7A17O14581 309 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SUSD5O60279 629 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SEC14L2O76054 403 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ACTL6AO96019 429 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 COX6A1P12074 109 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 CTSSP25774 331 aa4.05□□□□□ -1.76
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