RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ZNF584Q8IVC4 421 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 HERVK_113Q902F9 699 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 TMEM175Q9BSA9 504 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 KATNBL1Q9H079 304 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 NOX4Q9NPH5 578 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 LTBP3Q9NS15 1303 aa14.66□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 HMGN4O00479 90 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 TMPRSS11DO60235 418 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 AGR2O95994 175 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 CLUP10909 449 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ITGB8P26012 769 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ETV6P41212 452 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 RAB28P51157 221 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 FAM74A1Q5RGS3 127 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 LCN10Q6JVE6 187 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 GAREM2Q75VX8 874 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ZFP82Q8N141 532 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 OR10K1Q8NGX5 313 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 POTEKPQ9BYX7 375 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 SDHAF2Q9NX18 166 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 MARCH5Q9NX47 278 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ASIC5Q9NY37 505 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 RAB3DO95716 219 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 F13BP05160 661 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 PVRP15151 417 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 EPHA5P54756 1037 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ZG16BQ96DA0 208 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 NEURL3Q96EH8 262 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 PDXPQ96GD0 296 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 FCRL1Q96LA6 429 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 CASD1Q96PB1 797 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 SLC52A3Q9NQ40 469 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ASB4Q9Y574 426 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 METTL21EPA6NDL7 271 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 HCRTR2O43614 444 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 DLX5P56178 289 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 SLC35F2Q8IXU6 374 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 OR5AK2Q8NH90 309 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 CHAC2Q8WUX2 184 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ULBP3Q9BZM4 244 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 V9GY05 133 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 PAPPAQ13219 1627 aa14.65□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 TXNL1O43396 289 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 AIFM1O95831 613 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 CBR1P16152 277 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 CD34P28906 385 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 ZNF616Q08AN1 781 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 DHCR24Q15392 516 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 ARHGAP40Q5TG30 622 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 ASPGQ86U10 573 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 FAM26EQ8N5C1 309 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 OR52I2Q8NH67 350 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 IL21RQ9HBE5 538 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 HRASLS2Q9NWW9 162 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 ADRB3P13945 408 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 PDX1P52945 283 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 IRF3Q14653 427 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 PFN4Q8NHR9 129 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 HRH4Q9H3N8 390 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 TMEM72A0PK05 275 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 SSX5O60225 188 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 APODP05090 189 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 CYBAP13498 195 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 HTR2AP28223 471 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 MAGEB1P43366 347 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 PRLHRP49683 370 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 OR1Q1Q15612 314 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 KIAA1211LQ6NV74 962 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 CAMKVQ8NCB2 501 aa14.64□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 C2CD4CQ8TF44 421 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms