RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637083.1

CLN8-212, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-212ENST00000637083 CSF2P04141 144 aa11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 F8A1P23610 371 aa11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 EMDP50402 254 aa11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 ATP12AP54707 1039 aa11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 HSD17B7P56937 341 aa11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 RPS7P62081 194 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 SERTAD2Q14140 314 aa11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 OAFQ86UD1 273 aa11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 MARCH9Q86YJ5 346 aa11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 KLBQ86Z14 1044 aa11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 TDHQ8IZJ6 230 aa11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 ARL14Q8N4G2 192 aa11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 NEIL3Q8TAT5 605 aa11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 GRHL3Q8TE85 626 aa11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 ACOT12Q8WYK0 555 aa11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 PEX11GQ96HA9 241 aa11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 VSTM2LQ96N03 204 aa11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 ZNF649Q9BS31 505 aa11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 ALG8Q9BVK2 526 aa11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 TMED9Q9BVK6 235 aa11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 C20orf141Q9NUB4 165 aa11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 C14orf119Q9NWQ9 140 aa11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 HAO2Q9NYQ3 351 aa11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 HCN3Q9P1Z3 774 aa11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 PRODH2Q9UF12 536 aa11.2□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 FAM183AA6NL82 134 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 GABRPO00591 440 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 TMCC2O75069 709 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 PPM1BO75688 479 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 MT-ND5P03915 603 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 PEPDP12955 493 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 NOS3P29474 1203 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 FXYD6P3P58550 94 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 GALEQ14376 348 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 KLHL12Q53G59 568 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 Q6ZS52 159 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 GATAD2AQ86YP4 633 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 SIRT6Q8N6T7 355 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 SLC37A3Q8NCC5 494 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 OR13C2Q8NGS9 318 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 TEAD3Q99594 435 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 NDC1Q9BTX1 674 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 ZNF426Q9BUY5 554 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 HOXD1Q9GZZ0 328 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 PCED1AQ9H1Q7 454 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 H0YIG0 161 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 RNF13O43567 381 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 SLC19A2O60779 497 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 CLEC2LP0C7M8 214 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 SRFP11831 508 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 IL7P13232 177 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 NME1P15531 152 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 CD27P26842 260 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 CD38P28907 300 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 ZNF544Q6NX49 715 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 SHISA5Q8N114 240 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 CAMKK1Q8N5S9 505 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 ZNF285Q96NJ3 590 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 SLC22A4Q9H015 551 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 KLHL21Q9UJP4 597 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 OR10H1Q9Y4A9 318 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 GON4LQ3T8J9 2241 aa11.19□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 HCRTR1O43613 425 aa11.18□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 FOXS1O43638 330 aa11.18□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 DYRK3O43781 588 aa11.18□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 NDUFB2O95178 105 aa11.18□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 LALBAP00709 142 aa11.18□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 CHRNB1P11230 501 aa11.18□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 MTNR1BP49286 362 aa11.18□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 SLC16A1P53985 500 aa11.18□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 TPTEP56180 551 aa11.18□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 MAZP56270 477 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 LGALS3BPQ08380 585 aa11.18□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 FUT7Q11130 342 aa11.18□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 ZNF79Q15937 498 aa11.18□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 LCN1P1Q5VSP4 162 aa11.18□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 LINC00114Q6XXX2 140 aa11.18□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 PRR23CQ6ZRP0 262 aa11.18□□□□□ -0.62
CLN8-212ENST00000637083 ZFP41Q8N8Y5 198 aa11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.7 ms