RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 H7C2Y5 167 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 SSX4O60224 188 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 LGI1O95970 557 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 BIKQ13323 160 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 TP53I3Q53FA7 332 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 KLHL22Q53GT1 634 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF367Q7RTV3 350 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 WDR34Q96EX3 536 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 WACQ9BTA9 647 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 GABARAPL3Q9BY60 117 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 SMURF1Q9HCE7 757 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF222Q9UK12 451 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 FBXL4Q9UKA2 621 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 PROS1P07225 676 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 SOX2P48431 317 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 DESI1Q6ICB0 168 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 UXS1Q8NBZ7 420 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 OR52I1Q8NGK6 324 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 YIPF6Q96EC8 236 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 C20orf141Q9NUB4 165 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 UNC119BA6NIH7 251 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM229AB2RXF0 380 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 DCNP07585 359 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 KIR2DS3Q14952 304 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 ARSKQ6UWY0 536 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 RTL4Q6ZR62 310 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC38A6Q8IZM9 456 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 GALNT11Q8NCW6 608 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 NEIL3Q8TAT5 605 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 ADOQ96SZ5 270 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 PINK1Q9BXM7 581 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 LIPT1Q9Y234 373 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 NPIPB8E9PQR5 432 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 GPR75O95800 540 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 RD3LP0DJH9 198 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 ACP2P11117 423 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 TNFSF8P32971 234 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 OR2B6P58173 313 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 COX10Q12887 443 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 ZSWIM7Q19AV6 140 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM27D1Q5T7N8 215 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM239Q8WW34 195 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 LMF1Q96S06 567 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 SDF2Q99470 211 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 FSCN3Q9NQT6 498 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 OR2B3O76000 313 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 BLKP51451 505 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 PAQR7Q86WK9 346 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 OR8D4Q8NGM9 314 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 MMP27Q9H306 513 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 GNG8Q9UK08 70 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 REV3LO60673 3130 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A0J9YY10 115 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1B0GW55 424 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 ANKRD61A6NGH8 418 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 DYRK3O43781 588 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 UBXN7O94888 489 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 CFIP05156 583 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 DUX4L2P0CJ85 424 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 DUX4L3P0CJ86 424 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 DUX4L4P0CJ87 422 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 DUX4L5P0CJ88 424 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 DUX4L6P0CJ89 424 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 DUX4L7P0CJ90 424 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 GSTM3P21266 225 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 IFITM3Q01628 133 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 ILKQ13418 452 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 ZIC1Q15915 447 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 FRRS1Q6ZNA5 592 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 KLHL36Q8N4N3 616 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 RFKQ969G6 155 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 BPIFA2Q96DR5 249 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 LRIT1Q9P2V4 623 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 DUX4Q9UBX2 424 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 PFDN2Q9UHV9 154 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM150CB9EJG8 249 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 ADRA2AP08913 450 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 ACVR2AP27037 513 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 BTN1A1Q13410 526 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 ELOA3BQ3SY89 546 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 FBXO43Q4G163 708 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 LRRC17Q8N6Y2 441 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 ELOA3Q8NG57 546 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms