RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410016.5

HOXD3-202, Transcript of homeobox D3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXD3, Length 2,384 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3-202ENST00000410016 IL9P15248 144 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 S100A1P23297 94 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 MAP2K3P46734 347 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 CTBP2P56545 445 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 IL18Q14116 193 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 GALEQ14376 348 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 C9orf50Q5SZB4 431 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 GLCCI1Q86VQ1 547 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 COX18Q8N8Q8 333 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 SLC37A3Q8NCC5 494 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 C19orf18Q8NEA5 215 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 OR5T3Q8NGG3 340 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 OR52L1Q8NGH7 329 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 OR10G6Q8NH81 332 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 ENKURQ8TC29 256 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 BPIFA2Q96DR5 249 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 ARSGQ96EG1 525 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 ART5Q96L15 291 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 TEAD3Q99594 435 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 EVA1BQ9NVM1 165 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 BRINP1O60477 761 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 PTP4A3O75365 173 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 GPR75O95800 540 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 CT62P0C5K7 136 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 HLA-DMAP28067 261 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 MTNR1BP49286 362 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 TRIQKQ629K1 86 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 SDE2Q6IQ49 451 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 MZT2AQ6P582 158 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 FIGNL1Q6PIW4 674 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 CTHRC1Q96CG8 243 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 SIPA1Q96FS4 1042 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 TBX5Q99593 518 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 TTYH2Q9BSA4 534 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 MAT2BQ9NZL9 334 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD3-202ENST00000410016 E9PI62 339 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 HRO43593 1189 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 REM1O75628 298 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 RCBTB2O95199 551 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 RASGRP1O95267 797 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 CHRNB1P11230 501 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 PVRP15151 417 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 ELK1P19419 428 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 NT5EP21589 574 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 ALAS2P22557 587 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 ACSL1P33121 698 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 CDK10Q15131 360 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 QPRTQ15274 297 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 PLET1Q6UQ28 207 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 ZAR1Q86SH2 424 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 OR13C2Q8NGS9 318 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 KCNN2Q9H2S1 579 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 FBRSQ9HAH7 460 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 SCML1Q9UN30 329 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 SCN2AQ99250 2005 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 USP34Q70CQ2 3546 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 GXYLT2A0PJZ3 443 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 PBX2P40425 430 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 TATDN3Q17R31 274 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 KLHL12Q53G59 568 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 OR5W2Q8NH69 310 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 DAPL1A0PJW8 107 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 SGK494L7N484 410 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 TNFRSF10CO14798 259 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 LYRM1O43325 122 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 PLPP2O43688 288 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 EGFP01133 1207 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 PSKH1P11801 424 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 DRD5P21918 477 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 SHC1P29353 583 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 NOS3P29474 1203 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 GABRA3P34903 492 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 RACK1P63244 317 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 ALG11Q2TAA5 492 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 AMZ1Q400G9 498 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 UBASH3BQ8TF42 649 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 PATE1Q8WXA2 126 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 ACOT12Q8WYK0 555 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 RSC1A1Q92681 617 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 IFT27Q9BW83 186 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 PBX4Q9BYU1 374 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 FAM86C2PA6NEL3 165 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD3-202ENST00000410016 EPOPA6NHQ4 379 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 168.1 ms