RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARSKQ6UWY0 536 aa15.85■□□□□ 0.13
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CCNDBP1-204ENST00000563065 OR5M1Q8NGP8 315 aa15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR14L1PQ8NHC6 308 aa15.85■□□□□ 0.13
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CCNDBP1-204ENST00000563065 CA7P43166 264 aa15.82■□□□□ 0.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 CRISP3P54108 245 aa15.82■□□□□ 0.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 B3GALT5-AS1P59052 145 aa15.82■□□□□ 0.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 FGFBP1Q14512 234 aa15.82■□□□□ 0.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 COQ5Q5HYK3 327 aa15.82■□□□□ 0.12
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