RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557428.1

PCNX1-215, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCNX1, Length 541 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-215ENST00000557428 PROX1Q92786 737 aa7.15□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 MUCL1Q96DR8 90 aa7.15□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 MTBPQ96DY7 904 aa7.15□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 VSTM2LQ96N03 204 aa7.15□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 GPR22Q99680 433 aa7.15□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 PIMREGQ9BSJ6 248 aa7.15□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 MCMBPQ9BTE3 642 aa7.15□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 FAIM2Q9BWQ8 316 aa7.15□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 TXLNGYQ9BZA5 131 aa7.15□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 RTN4RQ9BZR6 473 aa7.15□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 NMRAL1Q9HBL8 299 aa7.15□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 CES1P1Q9UKY3 287 aa7.15□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 ABCG2Q9UNQ0 655 aa7.15□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 TGP01266 2768 aa7.15□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 SYCE1LA8MT33 242 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 E7EQL1 145 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 CLDN9O95484 217 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 IL33O95760 270 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 ANGPTL1O95841 491 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 IL11P20809 199 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 CRABP2P29373 138 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 TYK2P29597 1187 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 TTKP33981 857 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 PDLIM4P50479 330 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF83P51522 516 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 DLG1Q12959 904 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 P2RY6Q15077 328 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 DECR1Q16698 335 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 RINLQ6ZS11 566 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 CNPY4Q8N129 248 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 GABRG1Q8N1C3 465 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 CDYL2Q8N8U2 506 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 CDC26Q8NHZ8 85 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 KCTD4Q8WVF5 259 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 RNF145Q96MT1 663 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 ATOH8Q96SQ7 321 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 PAFAH2Q99487 392 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 DHRS9Q9BPW9 319 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 TRMOQ9BU70 441 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 GIMAP4Q9NUV9 329 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 TAS2R9Q9NYW1 312 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF180Q9UJW8 692 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 ADAM29Q9UKF5 820 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 RAB21Q9UL25 225 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 FKBP7Q9Y680 259 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 ATP23Q9Y6H3 246 aa7.14□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 A0A0J9YW62 118 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 M0R1B8 84 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 FADS1O60427 444 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 UGDHO60701 494 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 COQ9O75208 318 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 ERLIN1O75477 346 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 UTS2O95399 124 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF17P17021 662 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 EGR1P18146 543 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 HSD17B3P37058 310 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 CARD18P57730 90 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 PSPHP78330 225 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 CHRNEQ04844 493 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 IFFO1Q0D2I5 559 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 ITGADQ13349 1161 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 FAM219BQ5XKK7 198 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 FRG2Q64ET8 278 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 CCDC91Q7Z6B0 441 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 ISCA2Q86U28 154 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 FAM9CQ8IZT9 166 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 METTL4Q8N3J2 472 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 OR7G2Q8NG99 324 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 OR52N5Q8NH56 324 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 SGMS2Q8NHU3 365 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF675Q8TD23 568 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 RNF138Q8WVD3 245 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 OSTF1Q92882 214 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 TM4SF18Q96CE8 201 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 ADGRG7Q96K78 797 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 UBXN10Q96LJ8 280 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 KLHL15Q96M94 604 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms