RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	ORAI1	Q96D31	301 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	DKK3	Q9UBP4	350 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A0B4J203	849 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525		B4DGG1	531 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	FLRT2	O43155	660 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	FMO6P	O60774	539 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	CSF3	P09919	207 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	HOXB2	P14652	356 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	F8A1	P23610	371 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	IRF4	Q15306	451 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	EIPR1	Q53HC9	387 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	ARTN	Q5T4W7	220 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	NLRP8	Q86W28	1048 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC7A6	Q92536	515 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	MSANTD3	Q96H12	275 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	SGPP1	Q9BX95	441 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	OR10A4	Q9H209	315 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF69	Q9UC07	566 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	PSME4	Q14997	1843 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	VEGFB	P49765	207 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	TMC8	Q8IU68	726 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	LAS2	Q8IYD9	372 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	OR2L5	Q8NG80	312 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	OR8S1	Q8NH09	359 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	OR5W2	Q8NH69	310 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	THEM6	Q8WUY1	208 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	C17orf50	Q8WW18	174 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	OR2A14	Q96R47	310 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	LIPT1	Q9Y234	373 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	SI	P14410	1827 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	BRCA2	P51587	3418 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	PRPH2	P23942	346 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	BSG	P35613	385 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	PGGHG	Q32M88	737 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	OTP	Q5XKR4	325 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	GPR34	Q9UPC5	381 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525		A8MVJ9	347 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	SMARCD2	Q92925	531 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	RAD9A	Q99638	391 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	CHST8	Q9H2A9	424 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	LRIT2	A6NDA9	550 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	AGAP14	A8MT82	685 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	C11orf98	E9PRG8	122 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525		H0Y8X5	98 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	MT-ND4	P03905	459 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF24	P17028	368 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	DNASE1	P24855	282 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	CAPZA2	P47755	286 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	CRYBA2	P53672	197 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	RUNX3	Q13761	415 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC190	Q86UF4	302 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPIN3-223	ENST00000639525	FBXL6	Q8N531	539 aa		11.01	□□□□□ -0.65

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