RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384569.1

SNORD56.6-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 71 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56.6-201ENST00000384569 GPR143P51810 404 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 SMSP52788 366 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 NUBP1P53384 320 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 CRISP1P54107 249 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 ATP12AP54707 1039 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 CDH15P55291 814 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 CSNK2BP67870 215 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 PSG6Q00889 435 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 RHAGQ02094 409 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 MVKQ03426 396 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 MGAT2Q10469 447 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 EBPQ15125 230 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 NPTX1Q15818 432 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 MEP1AQ16819 746 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 TMEM44Q2T9K0 475 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 NADK2Q4G0N4 442 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 IQCCQ4KMZ1 466 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 VWA2Q5GFL6 755 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 ALG10BQ5I7T1 473 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 C6orf141Q5SZD1 244 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 ANKRD34AQ69YU3 496 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 SLC27A4Q6P1M0 643 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 PODNL1Q6PEZ8 512 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZNF613Q6PF04 617 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 NPSR1Q6W5P4 371 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 LANCL3Q6ZV70 420 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 PTCHD4Q6ZW05 846 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 AHSA2Q719I0 299 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 MED25Q71SY5 747 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 COX15Q7KZN9 410 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 GDF7Q7Z4P5 450 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 SATL1Q86VE3 508 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 CADM2Q8N3J6 435 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 STX19Q8N4C7 294 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 BCORP1Q8N888 145 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZNF540Q8NDQ6 660 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 SIMC1Q8NDZ2 872 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 OR4D11Q8NGI4 311 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 SLC22A8Q8TCC7 542 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 SLC7A13Q8TCU3 470 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 FCGR1BQ92637 280 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 DIO2Q92813 273 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 MR1Q95460 341 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 MYDGFQ969H8 173 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 VMP1Q96GC9 406 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 Q96MT0 163 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 NODALQ96S42 347 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 TSC22D3Q99576 134 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 LPAR4Q99677 370 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 CMKLR1Q99788 373 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 TRIM2Q9C040 744 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 YIPF3Q9GZM5 350 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 TGIF2Q9GZN2 237 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 WWTR1Q9GZV5 400 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 SAP130Q9H0E3 1048 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 TMEM9BQ9NQ34 198 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 RASSF1Q9NS23 344 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 RXFP3Q9NSD7 469 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 SEMA4GQ9NTN9 838 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 CLN6Q9NWW5 311 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 NCDNQ9UBB6 729 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 DTX4Q9Y2E6 619 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 MED31Q9Y3C7 131 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 CDH10Q9Y6N8 788 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 R4GN57 208 aa5.07□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 CACNA1HO95180 2353 aa5.06□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa5.06□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa5.06□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa5.06□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa5.06□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 FAM86C2PA6NEL3 165 aa5.06□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 SERINC4A6NH21 518 aa5.06□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 A6NHS1 94 aa5.06□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZAR1LA6NP61 321 aa5.06□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa5.06□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 HRKO00198 91 aa5.06□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 FFAR1O14842 300 aa5.06□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 MYL12BO14950 172 aa5.06□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 PIP5K1CO60331 668 aa5.06□□□□□ -1.6
SNORD56.6-201ENST00000384569 REM1O75628 298 aa5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms