RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483289.2

AC008040.1-202, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AC008040.1, Length 6,251 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC008040.1-202ENST00000483289 TMEM221A6NGB7 291 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 EPHA1P21709 976 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 WDR5P61964 334 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 LMAN2Q12907 356 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 INAVAQ3KP66 663 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 C14orf28Q4W4Y0 310 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 CTSL3PQ5NE16 218 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 MLIPQ5VWP3 458 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 TEX19Q8NA77 164 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 HERVK_113Q902F9 699 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 HAS2Q92819 552 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 MALSU1Q96EH3 234 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 SDHAF3Q9NRP4 125 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 BTNL2Q9UIR0 455 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 ACOT7O00154 380 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 ARNTLO00327 626 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 GPR143P51810 404 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 FXYD4P59646 89 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 RAB40BQ12829 278 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 STK11Q15831 433 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 FAM110CQ1W6H9 321 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 ZNF534Q76KX8 674 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 ZNF546Q86UE3 836 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 TRAM1L1Q8N609 369 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 KREMEN2Q8NCW0 462 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 PXT1Q8NFP0 134 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 OR4Q3Q8NH05 313 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 PAAF1Q9BRP4 392 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 TUBG2Q9NRH3 451 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 A0A0B4J2A0 478 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 CARNS1A5YM72 827 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 NPIPA7E9PJI5 369 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 ANKRD28O15084 1053 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 B3GALNT1O75752 331 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 GABARAPO95166 117 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 SCG5P05408 212 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 FAM163BP0C2L3 166 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 NPIPA8P0DM63 369 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 TYRP14679 529 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 RAB4BP61018 213 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 RNF111Q6ZNA4 994 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 PKMYT1Q99640 499 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 CERS4Q9HA82 394 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 TREX1Q9NSU2 369 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 WNT6Q9Y6F9 365 aa6.5□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 OR2A25A4D2G3 310 aa6.49□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 FAM183AA6NL82 134 aa6.49□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 LEFTY2O00292 366 aa6.49□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 ASGR2P07307 311 aa6.49□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 ACP2P11117 423 aa6.49□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 CDK2P24941 298 aa6.49□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 GP2P55259 537 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 SGCAQ16586 387 aa6.49□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 KDELC1Q6UW63 502 aa6.49□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.49□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa6.49□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 NRSN1Q8IZ57 195 aa6.49□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 APCDD1Q8J025 514 aa6.49□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 ST7LQ8TDW4 575 aa6.49□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.49□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 UBE2FQ969M7 185 aa6.49□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 C3orf49Q96BT1 292 aa6.49□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 OR2M4Q96R27 311 aa6.49□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 NT5DC2Q9H857 520 aa6.49□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 MED20Q9H944 212 aa6.49□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 RNF215Q9Y6U7 377 aa6.49□□□□□ -1.37
AC008040.1-202ENST00000483289 C1orf226A1L170 272 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms