RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 ASB6Q9NWX5 421 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRK-210ENST00000415055 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRK-210ENST00000415055 SELENONQ9NZV5 590 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRK-210ENST00000415055 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRK-210ENST00000415055 SLC17A6Q9P2U8 582 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRK-210ENST00000415055 ANAPC7Q9UJX3 599 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRK-210ENST00000415055 ACAD8Q9UKU7 415 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRK-210ENST00000415055 CMAHPQ9Y471 501 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRK-210ENST00000415055 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRK-210ENST00000415055 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 H0YGG7 62 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 VPS26AO75436 327 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 FTH1P02794 183 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 STATHP02808 62 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 RPN2P04844 631 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 TPBGLP0DKB5 382 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 ATP6V1B1P15313 513 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 CD9P21926 228 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 PTPN3P26045 913 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 SLC26A3P40879 764 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 ASCL1P50553 236 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 OR4D2P58180 307 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 PPIAP62937 165 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 DYNLT1P63172 113 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 UBXN1Q04323 297 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 SLC18A2Q05940 514 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 DMTNQ08495 405 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 PDK2Q15119 407 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 KRT31Q15323 416 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 NSDHLQ15738 373 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 HKDC1Q2TB90 917 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 TEX44Q53QW1 395 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 SFT2D3Q587I9 215 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF628Q5EBL2 1059 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 H3F3CQ6NXT2 135 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 LRRC8BQ6P9F7 803 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 PET117Q6UWS5 81 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 CFAP77Q6ZQR2 320 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 SNX20Q7Z614 316 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 ANKRD37Q7Z713 158 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 SERPINA9Q86WD7 417 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 KIF2BQ8N4N8 673 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 CSNK1A1LQ8N752 337 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 PQLC3Q8N755 202 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 AMER3Q8N944 861 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 LINC01555Q8NAE3 123 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 OR13C4Q8NGS5 318 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 M1APQ8TC57 530 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 DTX3LQ8TDB6 740 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 FBXL8Q96CD0 374 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 RNF183Q96D59 192 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 SPATA13Q96N96 652 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 DGAT2Q96PD7 388 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 BBS4Q96RK4 519 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 LPAR4Q99677 370 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 CCL19Q99731 98 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 APOL2Q9BQE5 337 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF670Q9BS34 389 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 FICDQ9BVA6 458 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 ACAT2Q9BWD1 397 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 KLHL4Q9C0H6 718 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 DRC3Q9H069 523 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 CXorf56Q9H5V9 222 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 UBTD1Q9HAC8 227 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 GRPEL1Q9HAV7 217 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 DECR2Q9NUI1 292 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 MRGBPQ9NV56 204 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 B4GALT7Q9UBV7 327 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 ANAPC5Q9UJX4 755 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 ERVK-11Q9UQG0 969 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 A0A1W2PQ72 361 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 TRBC2A0A5B9 178 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 LRRD1A4D1F6 860 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 DPPA5A6NC42 116 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 TARM1B6A8C7 271 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 G3V3Y1 287 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 CLDN4O14493 209 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 RRHO14718 337 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 BCKDKO14874 412 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 CASKO14936 926 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
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