RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AMER2Q8N7J2 671 aa17.44■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MND1Q9BWT6 205 aa17.44■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SAP130Q9H0E3 1048 aa17.44■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DUSP22Q9NRW4 184 aa17.44■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SATB2Q9UPW6 733 aa17.44■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FUOMA2VDF0 154 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STX11O75558 287 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHRNB1P11230 501 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUDT1P36639 197 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MGAT2Q10469 447 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAP4K2Q12851 820 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPHARQ15513 63 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF619Q8N2I2 560 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM163Q8TC26 289 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RLN3Q8WXF3 142 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIK3R3Q92569 461 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HHATLQ9HCP6 504 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A3GALT2U3KPV4 340 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RDH16O75452 317 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CTSBP07858 339 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CT62P0C5K7 136 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGFBP4P22692 258 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FPR3P25089 353 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BCAP31P51572 246 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF136P52737 540 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAB38P57729 211 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAPK14Q16539 360 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NRMQ8IXM6 262 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NANOGP1Q8N7R0 232 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COX18Q8N8Q8 333 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PROKR2Q8NFJ6 384 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR52I1Q8NGK6 324 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STACQ99469 402 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MROQ9BYG7 248 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RACGAP1Q9H0H5 632 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLCA2Q9UQC9 943 aa17.43■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IFI6P09912 130 aa17.42■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SOX3P41225 446 aa17.42■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa17.42■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa17.42■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa17.42■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF217Q8TC41 542 aa17.42■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM255BQ8WV15 326 aa17.42■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CTHRC1Q96CG8 243 aa17.42■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDADC1Q9BWV3 514 aa17.42■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBXO34Q9NWN3 711 aa17.42■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC7A7Q9UM01 511 aa17.42■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIOO75962 3097 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLF4O43474 513 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIAA0513O60268 411 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIP5K1CO60331 668 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAB36O95755 333 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DBIP07108 87 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HBQ1P09105 142 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SRFP11831 508 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAP3K8P41279 467 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR4P46093 362 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OXA1LQ15070 435 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PAQR6Q6TCH4 344 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC36A4Q6YBV0 504 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C11orf74Q86VG3 221 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSTD1Q8NFU3 115 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR9A4Q8NGU2 314 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR151Q8TDV0 419 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC38A2Q96QD8 506 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TPSD1Q9BZJ3 242 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNE5Q9UJ90 142 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR52Q9Y2T5 361 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYL12BO14950 172 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRODHO43272 600 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MBTPS2O43462 519 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPX5O75715 221 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NID1P14543 1247 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GNSP15586 552 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDH3P22223 829 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STAT5AP42229 794 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IFITM3Q01628 133 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNX29P2Q8IUI4 249 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AVL9Q8NBF6 648 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POGLUT1Q8NBL1 392 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL20Q9NYY1 176 aa17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms