RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403084.1

CLDN5-201, Transcript of claudin 5, humanhuman

BASIC

Gene CLDN5, Length 2,357 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5-201ENST00000403084 FAM71CQ8NEG0 241 aa20.49■□□□□ 0.87
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CLDN5-201ENST00000403084 FAM27D1Q5T7N8 215 aa20.45■□□□□ 0.86
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CLDN5-201ENST00000403084 HS6ST3Q8IZP7 471 aa20.45■□□□□ 0.86
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