RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468468.5

TSPAN4-211, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 2,777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-211ENST00000468468 EPOPA6NHQ4 379 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 RFXAPO00287 272 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ERI3O43414 337 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 NAT2P11245 290 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 BCL6P41182 706 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 CDH11P55287 796 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 WSCD2Q2TBF2 565 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 LCN1P1Q5VSP4 162 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 TRIM48Q8IWZ4 208 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ELMOD2Q8IZ81 293 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 OR2A1Q8NGT9 310 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ENKURQ8TC29 256 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 SFXN5Q8TD22 340 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 BEX2Q9BXY8 128 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 PBX4Q9BYU1 374 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 MALT1Q9UDY8 824 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 LALBAP00709 142 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 GJA4P35212 333 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 SLC1A3P43003 542 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 GNG2P59768 71 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 PPP3R1P63098 170 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 QPRTQ15274 297 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 TMEM35AQ53FP2 167 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 OR4F15Q8NGB8 312 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 OR56A1Q8NGH5 318 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 CHFRQ96EP1 664 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 OR7D2Q96RA2 312 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 COQ7Q99807 217 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 TBC1D17Q9HA65 648 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 PRSS16Q9NQE7 514 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 GIMAP4Q9NUV9 329 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ENTPD4Q9Y227 616 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ASB4Q9Y574 426 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 A0A0B4J293 547 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ERVH48-1M5A8F1 160 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 LATO43561 262 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 HPGDSO60760 199 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ALPPP05187 535 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 GNSP15586 552 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 RUNX3Q13761 415 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 C18orf63Q68DL7 685 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 SLC30A6Q6NXT4 461 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 CNIH2Q6PI25 160 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ACOT4Q8N9L9 421 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 TTLQ8NG68 377 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 RNF31Q96EP0 1072 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 TMED9Q9BVK6 235 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 PRRG3Q9BZD7 231 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 SLC38A1Q9H2H9 487 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 OR1A2Q9Y585 309 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 LINC01565O15544 149 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ACP5P13686 325 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ST3GAL3Q11203 375 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 PDGFRLQ15198 375 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 NOXA1Q86UR1 476 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ZNF485Q8NCK3 441 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 C19orf18Q8NEA5 215 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 PIGXQ8TBF5 258 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 DIO2Q92813 273 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 MS4A6EQ96DS6 147 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 HDHD5Q9BXW7 423 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 B3GNT4Q9C0J1 378 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 PRDM7Q9NQW5 492 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa14.79□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 SYT5O00445 386 aa14.78□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 PCDH8O95206 1070 aa14.78□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 AIFM1O95831 613 aa14.78□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 CCNYL3P0C7X3 344 aa14.78□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 OMPP47874 163 aa14.78□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 AVPR1BP47901 424 aa14.78□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 CD83Q01151 205 aa14.78□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 TGM3Q08188 693 aa14.78□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ZIC1Q15915 447 aa14.78□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa14.78□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 TRIQKQ629K1 86 aa14.78□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 MARCH9Q86YJ5 346 aa14.78□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ESX1Q8N693 406 aa14.78□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 RNF170Q96K19 258 aa14.78□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 CITED4Q96RK1 184 aa14.78□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ARHGDIGQ99819 225 aa14.78□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 HDAC8Q9BY41 377 aa14.78□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 GDE1Q9NZC3 331 aa14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms