RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 LAS2Q8IYD9 372 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TDHQ8IZJ6 230 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 OR7G3Q8NG95 312 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 NR4A3Q92570 626 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 RFKQ969G6 155 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 PHF21AQ96BD5 680 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 PPP1R16AQ96I34 528 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 COPS8Q99627 209 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 HDHD5Q9BXW7 423 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 BEX2Q9BXY8 128 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 BPIFA1Q9NP55 256 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ATP6V1HQ9UI12 483 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 KIF25Q9UIL4 384 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 MAB21L2Q9Y586 359 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CDH10Q9Y6N8 788 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1B0GW55 424 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 IQCF5A8MTL0 148 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 KRBOX1C9JBD0 128 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 QSOX1O00391 747 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SGTAO43765 313 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SOCS5O75159 536 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 DUX4L2P0CJ85 424 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 DUX4L3P0CJ86 424 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 DUX4L4P0CJ87 422 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 DUX4L5P0CJ88 424 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 DUX4L6P0CJ89 424 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 DUX4L7P0CJ90 424 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 RRASP10301 218 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 EPCAMP16422 314 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SLC6A1P30531 599 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CAPZA2P47755 286 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 MAN2A2P49641 1150 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 IRF8Q02556 426 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 MXD1Q05195 221 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ACSM1Q08AH1 577 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 MFSD13AQ14CX5 517 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 GARNL3Q5VVW2 1013 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TXNDC8Q6A555 127 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 NADSYN1Q6IA69 706 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CNIH2Q6PI25 160 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 HTR3DQ70Z44 454 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 UTS2BQ765I0 119 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 GLRX5Q86SX6 157 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 DENND1CQ8IV53 801 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CPXM2Q8N436 756 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 OR52J3Q8NH60 311 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 DIO2Q92813 273 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 KATNB1Q9BVA0 655 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TSSK6Q9BXA6 273 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SFXN1Q9H9B4 322 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 MED9Q9NWA0 146 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 NLKQ9UBE8 527 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 DUX4Q9UBX2 424 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PQ67 120 aa6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 H3BN98 237 aa6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CASC3O15234 703 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TGM6O95932 706 aa6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 RHOP08100 348 aa6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ACP2P11117 423 aa6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 LAMP1P11279 417 aa6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 IFI30P13284 250 aa6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 GLB1P16278 677 aa6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 F8A1P23610 371 aa6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 AOAHP28039 575 aa6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 POU1F1P28069 291 aa6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 IFNGR2P38484 337 aa6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 MMP12P39900 470 aa6.77□□□□□ -1.33
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