RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 EMC4Q5J8M3 183 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 C6orf136Q5SQH8 315 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM107Q6UX40 140 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 RTL4Q6ZR62 310 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 DOLPP1Q86YN1 238 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SPPL2CQ8IUH8 684 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 DDIASQ8IXT1 998 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 LIX1Q8N485 282 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM13CQ8NE31 585 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 OR7A2PQ8NGA2 310 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM76AQ8TAV0 307 aa6.43□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 SPPL2AQ8TCT8 520 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 MGARPQ8TDB4 240 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 RELTQ969Z4 430 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TP53INP1Q96A56 240 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 OMA1Q96E52 524 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC120Q96HB5 630 aa6.43□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 AMDHD1Q96NU7 426 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 BBS4Q96RK4 519 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 C1orf50Q9BV19 199 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 RTN4RQ9BZR6 473 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 FOLH1BQ9HBA9 442 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PFDN4Q9NQP4 134 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SACM1LQ9NTJ5 587 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 FLRT3Q9NZU0 649 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 HAO1Q9UJM8 370 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PSME2Q9UL46 239 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM120BA0PK00 339 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 POM121CA8CG34 1229 aa6.42□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 CCL21O00585 134 aa6.42□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 TFECO14948 347 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TO15178 435 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TM9SF1O15321 606 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 BIRC5O15392 142 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 DYRK3O43781 588 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PLOD3O60568 738 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC19A2O60779 497 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TBX19O60806 448 aa6.42□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZWINTO95229 277 aa6.42□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 HSPA4LO95757 839 aa6.42□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 P04436 131 aa6.42□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 TUBBP07437 444 aa6.42□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 MAP3K8P41279 467 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CASP3P42574 277 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PPICP45877 212 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 GAS1P54826 345 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PHC1P78364 1004 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PSG6Q00889 435 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PLGLB1Q02325 96 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 STX3Q13277 289 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 GAB1Q13480 694 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PTGR1Q14914 329 aa6.42□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 GHDCQ8N2G8 530 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXW8Q8N3Y1 598 aa6.42□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 POGLUT1Q8NBL1 392 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 RNF138Q8WVD3 245 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TMBIM1Q969X1 311 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ELP4Q96EB1 424 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 GIMAP5Q96F15 307 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 C16orf58Q96GQ5 468 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SGCZQ96LD1 299 aa6.42□□□□□ -1.38
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