RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 SACM1LQ9NTJ5 587 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM221BA6H8Z2 402 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 B4GAT1O43505 415 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 PRKACBP22694 351 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 MBLAC2Q68D91 279 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 KREMEN2Q8NCW0 462 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 TSPEARQ8WU66 669 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 SMPDL3AQ92484 453 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 PDZD7Q9H5P4 517 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 GJE1A6NN92 205 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 RPS24P62847 133 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 USP51Q70EK9 711 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 SCML4Q8N228 414 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 CLEC4CQ8WTT0 213 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 ACAD8Q9UKU7 415 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 TSPAN11A1L157 253 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 FLT3LGP49771 235 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 SPANXN4Q5MJ08 99 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 C6orf141Q5SZD1 244 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 SPIN2AQ99865 258 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 TECPR2O15040 1411 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 A8MT66 165 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 F2RP25116 425 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 GPX6P59796 221 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 SFT2D3Q587I9 215 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 HES5Q5TA89 166 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 REEP4Q9H6H4 257 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 SERPINE2P07093 398 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF860A6NHJ4 632 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 SOX3P41225 446 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 SOX9P48436 509 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 OR5AK2Q8NH90 309 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 GLTPQ9NZD2 209 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 DIP2AQ14689 1571 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 LRRTM2O43300 516 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 OR9I1Q8NGQ6 314 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 PYCR1P32322 319 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 PITPNBP48739 271 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 ABHD18Q0P651 414 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 SMYD5Q6GMV2 418 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A1W2PS29 197 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 GAAP10253 952 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF585AQ6P3V2 769 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 LEG1Q6P5S2 330 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 FBXW12Q6X9E4 464 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 NLRP8Q86W28 1048 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 HRH4Q9H3N8 390 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 KLHL42Q9P2K6 505 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 CD300AQ9UGN4 299 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 DISP1Q96F81 1524 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 DVL1O14640 695 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 SYT7O43581 403 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 SERPINF1P36955 418 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 SPATS1Q496A3 300 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 KIAA1211LQ6NV74 962 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 Q6ZVU0 165 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 DNAJB11Q9UBS4 358 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 ASB3Q9Y575 518 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 APLNRP35414 380 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 TREML2Q5T2D2 321 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 RNF111Q6ZNA4 994 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 LIPHQ8WWY8 451 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM173AQ9BQD7 235 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 OR6C2Q9NZP2 312 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 FETUBQ9UGM5 382 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 USP32Q8NFA0 1604 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 KLRC4O43908 158 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM41BQ5BJD5 291 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 GPR155Q7Z3F1 870 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC2A8Q9NY64 477 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 C20orf202A1L168 122 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 FOXN2P32314 431 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 METTL11BQ5VVY1 283 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 ERMP1Q7Z2K6 904 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 GINS3Q9BRX5 216 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 CLDND1Q9NY35 253 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRJ-207ENST00000613246 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms