RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 GRIA1P42261 906 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MAGEA3P43357 314 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SLC6A12P48065 614 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 COMPP49747 757 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RGS6P49758 472 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FLT3LGP49771 235 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 STK19P49842 368 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TPMTP51580 245 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 NDST1P52848 882 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MLF1P58340 268 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ERVS71-1P61550 626 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RPS7P62081 194 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 GNGT1P63211 74 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 KCNJ2P63252 427 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PITPNAQ00169 270 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 IRF8Q02556 426 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 HSF2Q03933 536 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MZT1Q08AG7 82 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 STX4Q12846 297 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PDCLQ13371 301 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 AQP6Q13520 282 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 GRAPQ13588 217 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RAB32Q13637 225 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ARL6IP1Q15041 203 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 IRF4Q15306 451 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PSG3Q16557 428 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC24Q50LG9 513 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ESCO2Q56NI9 601 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 XKR7Q5GH72 579 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FAM46CQ5VWP2 391 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 METRNLQ641Q3 311 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 C11orf63Q6NUN7 778 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SPESP1Q6UW49 350 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CD300LGQ6UXG3 332 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FAM92BQ6ZTR7 304 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PAQR9Q6ZVX9 377 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 DPPA4Q7L190 304 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 C16orf62Q7Z3J2 963 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PRSS42Q7Z5A4 293 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 NT5DC3Q86UY8 548 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF100Q8IYN0 542 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ABRAQ8N0Z2 381 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ZFP82Q8N141 532 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 METTL4Q8N3J2 472 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FBXO39Q8N4B4 442 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 STX19Q8N4C7 294 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PQLC3Q8N755 202 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 VGLL2Q8N8G2 317 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CLEC1AQ8NC01 280 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MCUQ8NE86 351 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CATSPER1Q8NEC5 780 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PROKR2Q8NFJ6 384 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RHEBL1Q8TAI7 183 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 STOML3Q8TAV4 291 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 GDPD5Q8WTR4 605 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FAM222BQ8WU58 562 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ASB5Q8WWX0 329 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 DNAJC9Q8WXX5 260 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TFAP2CQ92754 450 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 UFD1Q92890 307 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SLC38A4Q969I6 547 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TMBIM1Q969X1 311 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TESCQ96BS2 214 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 R3HDM4Q96D70 268 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ASB9Q96DX5 294 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FAM210BQ96KR6 192 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF583Q96ND8 569 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 WDFY2Q96P53 400 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SERPINB12Q96P63 405 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SLC22A12Q96S37 553 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 NPAS1Q99742 590 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 EGFL8Q99944 293 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 KLHDC3Q9BQ90 382 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM43Q9BTV4 400 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CHRDL1Q9BU40 450 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MYL10Q9BUA6 226 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MSTO1Q9BUK6 570 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FICDQ9BVA6 458 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 IFT27Q9BW83 186 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MND1Q9BWT6 205 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FSD1LQ9BXM9 530 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM9Q9C026 710 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SRRQ9GZT4 340 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ATG10Q9H0Y0 220 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PCDHAC1Q9H158 963 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PPA2Q9H2U2 334 aa2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms