RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447480.5

TRIM4-204, Transcript of tripartite motif containing 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRIM4, Length 639 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4-204ENST00000447480 LYRM1O43325 122 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 CHST10O43529 356 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 SH3BP5O60239 455 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 RAF1P04049 648 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 HSMCR30P0CW71 290 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 SRCP12931 536 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 JUPP14923 745 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 SDC1P18827 310 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 HIST1H2ADP20671 130 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 ITGALP20701 1170 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 C5AR1P21730 350 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 GABRA5P31644 462 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 XCR1P46094 333 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 GSTM5P46439 218 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 STK19P49842 368 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 ETV1P50549 477 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 CTAG1AP78358 180 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 SHC2P98077 582 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 BDH1Q02338 343 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 BCL2L1Q07817 233 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 RGS1Q08116 209 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 RAB40BQ12829 278 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 MAP4K2Q12851 820 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 SLAMF1Q13291 335 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 ENPP2Q13822 863 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 ZNF234Q14588 700 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 IHHQ14623 411 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 RGNQ15493 299 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 TRAM1Q15629 374 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 WSCD2Q2TBF2 565 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 ZNF528Q3MIS6 628 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 PYDC2Q56P42 97 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 Q5BKY6 102 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 CPTPQ5TA50 214 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 TMEM164Q5U3C3 297 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 FRG2Q64ET8 278 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 C12orf73Q69YU5 71 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 C22orf39Q6P5X5 142 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 SLC36A4Q6YBV0 504 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 ZNF621Q6ZSS3 439 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 USP30Q70CQ3 517 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 RABEPKQ7Z6M1 372 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 PHC2Q8IXK0 858 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 PHACTR4Q8IZ21 702 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 LGI4Q8N135 537 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 ZBTB2Q8N680 514 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 ZNF680Q8NEM1 530 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 OR7D4Q8NG98 312 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 OR52N2Q8NGI0 321 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 ASB13Q8WXK3 278 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 WBP2Q969T9 261 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 OMA1Q96E52 524 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 ALG14Q96F25 216 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 CMTM3Q96MX0 182 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 KCNC2Q96PR1 638 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 FRG2BQ96QU4 278 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 HIST1H2AJQ99878 128 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 EGFL8Q99944 293 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 KCNS3Q9BQ31 491 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 H2AFJQ9BTM1 129 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 JAM3Q9BX67 310 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 BARHL1Q9BZE3 327 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 ACPTQ9BZG2 426 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 UCK2Q9BZX2 261 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 BRD7Q9NPI1 651 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 ACER3Q9NUN7 267 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 VPS29Q9UBQ0 182 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 FTSJ1Q9UET6 329 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 IL36AQ9UHA7 158 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 ATP6V1HQ9UI12 483 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 UTS2RQ9UKP6 389 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 FBXO4Q9UKT5 387 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 TMCC3Q9ULS5 477 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 FZD4Q9ULV1 537 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 CDH10Q9Y6N8 788 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 XIRP2A4UGR9 3374 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 TTC28Q96AY4 2481 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 C5orf42Q9H799 3197 aa7.18□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa7.18□□□□□ -1.26
TRIM4-204ENST00000447480 A0A0D9SEW6 157 aa7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms