RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025522.10

Pdgfrb-201, Transcript of Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdgfrb, Length 5,407 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Spry1Q9QXV9 313 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr1555-ps1A0A140LHT7 321 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zfp14P10755 501 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 LplP11152 474 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 GsrP47791 500 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vamp2P63044 116 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dlk1Q09163 385 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fam71bQ5STT6 665 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr714Q7TRN0 317 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr299Q7TS05 330 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lcn10Q810Z1 182 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Hdac8Q8VH37 377 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ddx1Q91VR5 740 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pex16Q91XC9 336 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PsphQ99LS3 225 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pink1Q99MQ3 580 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mrpl21Q9D1N9 209 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lingo1Q9D1T0 614 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc7a8Q9QXW9 531 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Smim17A0A504 109 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fbrsl1E9Q9T0 1031 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PtgdsO09114 189 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cx3cl1O35188 395 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cma1P21844 247 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rpl19P84099 196 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Garem1Q3UFT3 876 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Glb1l2Q3UPY5 636 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cfhr2Q4LDF6 332 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 BC080695Q66JY9 481 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Got1l1Q7TSV6 404 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mettl20Q80ZM3 255 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gpr146Q99LE2 333 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sohlh2Q9D489 467 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Alg5Q9DB25 324 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cd302Q9DCG2 228 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Prl3c1Q9QUN5 212 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Hipk2Q9QZR5 1196 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Kiaa1522A2A7S8 1013 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Prrt4B2RU40 902 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pdia2D3Z6P0 527 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Eif5aP63242 154 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 BidP70444 195 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pag1Q3U1F9 429 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cobll1Q3UMF0 1273 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc35f2Q7TML3 375 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmem185bQ8R3R5 350 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cbr4Q91VT4 236 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 GlyatQ91XE0 296 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rps21Q9CQR2 83 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trhr2Q9ERT2 382 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gfra4Q9JJT2 260 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cldn24D3YXJ9 220 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PfplQ5RKV8 702 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nr1d2Q60674 576 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Kctd7Q8BJK1 289 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Znf628Q8CJ78 1038 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 BphlQ8R164 291 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 C8gQ8VCG4 202 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 GmfbQ9CQI3 142 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cacng3Q9JJV5 315 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zfp981A2A8V7 445 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lcn11A2BHR2 178 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pgm2A2CEK3 580 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn2r110E9PWD5 858 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zfp1P08042 402 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Alox12eP55249 662 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PrtgQ2EY15 1191 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 CtrcQ3SYP2 268 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Hp1bp3Q3TEA8 554 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cdk15Q3V3A1 433 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 ZpbpQ62522 350 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ddx51Q6P9R1 639 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gpr171Q8BG55 319 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tp53inp2Q8CFU8 221 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmem17Q8K0U3 198 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Scpep1Q920A5 452 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dtwd1Q9D8U7 304 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cypt12Q9DAR6 119 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 TrehQ9JLT2 576 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm3327F7C9A1 213 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm8857L7N291 182 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fmo5P97872 533 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cd244Q07763 397 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pcbp2Q61990 362 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 BpiQ67E05 483 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cldn34b3Q80ZS5 209 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nipal3Q8BGN5 410 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fam124bQ8BLQ0 456 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Stfa2l1Q8BWM3 103 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc41a2Q8BYR8 573 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Stk-ps2Q8C0V7 499 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Abhd18Q8C1A9 464 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Usb1Q91W78 267 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zdhhc13Q9CWU2 622 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Amdhd1Q9DBA8 426 aa10.43□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rdh8D3Z6W3 317 aa10.42□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr631F8VPJ9 319 aa10.42□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr519K7N645 319 aa10.42□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ninj1O70131 152 aa10.42□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cd300lgQ1ERP8 331 aa10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 57.6 ms