RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 SPRED3Q2MJR0 410 aa15.69■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 ZNF750Q32MQ0 723 aa15.69■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 NADK2Q4G0N4 442 aa15.69■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 LANCL3Q6ZV70 420 aa15.69■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 ZFP28Q8NHY6 868 aa15.69■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa15.69■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 VPS33AQ96AX1 596 aa15.69■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 OR52E6Q96RD3 313 aa15.69■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 BBS4Q96RK4 519 aa15.69■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 GLIPR2Q9H4G4 154 aa15.69■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 ADAP2Q9NPF8 381 aa15.69■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 SERHLQ9NQF3 203 aa15.69■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa15.69■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 A0A1W2PRB8 838 aa15.68■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 CCDC154A6NI56 674 aa15.68■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 BBIP1A8MTZ0 92 aa15.68■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 DNAJB5O75953 348 aa15.68■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 COX4I1P13073 169 aa15.68■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 MGAT2Q10469 447 aa15.68■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 VPS26BQ4G0F5 336 aa15.68■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 ZNF628Q5EBL2 1059 aa15.68■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 FAM69BQ5VUD6 431 aa15.68■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 FAM180BQ6P0A1 224 aa15.68■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa15.68■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa15.68■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 SNX32Q86XE0 403 aa15.68■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 DPP10Q8N608 796 aa15.68■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 VPS37AQ8NEZ2 397 aa15.68■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 METTL21AQ8WXB1 218 aa15.68■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 GTF2H4Q92759 462 aa15.68■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 CTHRC1Q96CG8 243 aa15.68■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 DGAT2Q96PD7 388 aa15.68■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 CXorf21Q9HAI6 301 aa15.68■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 NEUROD4Q9HD90 331 aa15.68■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 MKRN2OSH3BPM6 223 aa15.67■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 PLOD2O00469 737 aa15.67■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 FBP2O00757 339 aa15.67■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 SOCS6O14544 535 aa15.67■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 CREG1O75629 220 aa15.67■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 TRPC1P48995 793 aa15.67■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP15.67■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 MAP4K2Q12851 820 aa15.67■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 IL10RAQ13651 578 aa15.67■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa15.67■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 C6orf89Q6UWU4 347 aa15.67■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa15.67■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 RETREG3Q86VR2 466 aa15.67■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 CCDC116Q8IYX3 515 aa15.67■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 CLECL1Q8IZS7 167 aa15.67■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 CMTM5Q96DZ9 223 aa15.67■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 ZNF700Q9H0M5 742 aa15.67■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 RMND5AQ9H871 391 aa15.67■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 MAT2BQ9NZL9 334 aa15.67■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 NTMQ9P121 344 aa15.67■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 ZNF639Q9UID6 485 aa15.67■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 ERVK-11Q9UQG0 969 aa15.67■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 PCSK5Q92824 1860 aa15.67■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 A0A087WV62 115 aa15.66■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 OR10H2O60403 315 aa15.66■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 C6orf47O95873 294 aa15.66■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 ZCCHC18P0CG32 403 aa15.66■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 PTPN6P29350 595 aa15.66■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 MANFP55145 182 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 OR4D2P58180 307 aa15.66■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 HBA1P69905 142 aa15.66■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 STX5Q13190 355 aa15.66■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 PCOLCEQ15113 449 aa15.66■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 MAPKAPK3Q16644 382 aa15.66■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 SFT2D3Q587I9 215 aa15.66■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 PAGE3Q5JUK9 113 aa15.66■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 LRIF1Q5T3J3 769 aa15.66■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 KIRREL2Q6UWL6 708 aa15.66■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 TMEM64Q6YI46 380 aa15.66■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 RAB43Q86YS6 212 aa15.66■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 GALNT12Q8IXK2 581 aa15.66■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 Q8NA96 180 aa15.66■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 OR9A2Q8NGT5 310 aa15.66■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 OR14A16Q8NHC5 309 aa15.66■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 DNAJB8Q8NHS0 232 aa15.66■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 ITCHQ96J02 903 aa15.66■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 IP6K3Q96PC2 410 aa15.66■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 MESP1Q9BRJ9 268 aa15.66■□□□□ 0.1
PACS1-208ENST00000529677 ARL8BQ9NVJ2 186 aa15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.9 ms