RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	SLC34A3	Q8N130	599 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	LINC00471	Q8N535	108 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	SFXN5	Q8TD22	340 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	MND1	Q9BWT6	205 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	ASB4	Q9Y574	426 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	KDM1A	O60341	852 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	KAT7	O95251	611 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	LGI1	O95970	557 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	CHRM4	P08173	479 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	GJA4	P35212	333 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	SOX3	P41225	446 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	SLC9A5	Q14940	896 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	MORN4	Q8NDC4	146 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	HERVK_113	Q902F9	699 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	HPS1	Q92902	700 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	BBS4	Q96RK4	519 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	PRR19	A6NJB7	356 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	GLOD5	A6NK44	160 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	TNNI3	P19429	210 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	MAN2A2	P49641	1150 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	HTRA1	Q92743	480 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	FGF11	Q92914	225 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	ARMC5	Q96C12	935 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	CHFR	Q96EP1	664 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	NUAK2	Q9H093	628 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058		A0A1W2PR48	441 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	PGRMC2	O15173	223 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	LAT	O43561	262 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	PRKY	O43930	277 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	KCNK2	O95069	426 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	HBQ1	P09105	142 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	15.96	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	PCYT1A	P49585	367 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	EFNB1	P98172	346 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	SLAMF1	Q13291	335 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	C2orf27A	Q580R0	203 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	15.96	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	PRRC1	Q96M27	445 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	ASPN	Q9BXN1	380 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	KCNK6	Q9Y257	313 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		15.95	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	STATH	P02808	62 aa		15.95	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	MYOG	P15173	224 aa		15.95	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	SPN	P16150	400 aa		15.95	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	ALOX12	P18054	663 aa		15.95	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	CRYBB2	P43320	205 aa		15.95	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	15.95	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	CDK5	Q00535	292 aa		15.95	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	DUSP2	Q05923	314 aa		15.95	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	RUNX3	Q13761	415 aa		15.95	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	ENPP2	Q13822	863 aa		15.95	■□□□□ 0.14

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