RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM92BQ6ZTR7 304 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 PRAP1Q96NZ9 151 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 ROGDIQ9GZN7 287 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 MKLN1Q9UL63 735 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 TLR4O00206 839 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 CCRL2O00421 344 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGAP33O14559 1287 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 KIAA0513O60268 411 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 DLGAP3O95886 979 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 SERPIND1P05546 499 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 CCR8P51685 355 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 REEP5Q00765 189 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 DCST1Q5T197 706 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 SLX4IPQ5VYV7 408 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 METRNLQ641Q3 311 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 ADCK2Q7Z695 626 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 OR4D11Q8NGI4 311 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF354BQ96LW1 612 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 C12orf66Q96MD2 445 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 IL4I1Q96RQ9 567 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 C11orf16Q9NQ32 467 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 PIAS3Q9Y6X2 628 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 NARSO43776 548 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 TMPRSS11DO60235 418 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 GSTT2P0CG29 244 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 GSTT2BP0CG30 244 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 ACSL1P33121 698 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 HSD17B2P37059 387 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 SSX1Q16384 188 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM201Q5SNT2 666 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 AKAP14Q86UN6 197 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 CHAC2Q8WUX2 184 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 QRFPRQ96P65 431 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 WFDC6Q9BQY6 131 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 FUZQ9BT04 418 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 SERHL2Q9H4I8 314 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 NT5DC2Q9H857 520 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 POU2F3Q9UKI9 436 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 ACAD8Q9UKU7 415 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 SNX11Q9Y5W9 270 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1W2PPV9 198 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 PDZK1P1A8MUH7 402 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 PTGER1P34995 402 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 DESI1Q6ICB0 168 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 CCL4L1Q8NHW4 92 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 CTRCQ99895 268 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 ANHXE9PGG2 379 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 FAAHO00519 579 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 DNTTP04053 509 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 H1F0P07305 194 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 DDX5P17844 614 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 SPDYE7PQ495Y7 208 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 C12orf73Q69YU5 71 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 UBE3DQ7Z6J8 389 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC190Q86UF4 302 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC17A9Q9BYT1 436 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 PCBD2Q9H0N5 130 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 WASHC1A8K0Z3 465 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 RPN2P04844 631 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 ALOX12P18054 663 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 C5AR1P21730 350 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 AK4P27144 223 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 NTSR1P30989 418 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 FEN1P39748 380 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 CCT3P49368 545 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 ADPRHP54922 357 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 RHAGQ02094 409 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 WASH2PQ6VEQ5 465 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 GDPD3Q7L5L3 318 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 NUDT13Q86X67 352 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 RGMAQ96B86 450 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 OPALINQ96PE5 141 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 FERD3LQ96RJ6 166 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 SH3BP5O60239 455 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 OR10H3O60404 316 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 SOX14O95416 240 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 IGFALSP35858 605 aa17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms