RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497425.1

TTC21B-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 21B, human

TSL 3

Gene TTC21B, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC21B-208	ENST00000497425	ECSCR	Q19T08	205 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	C14orf177	Q52M58	125 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	LIPJ	Q5W064	366 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425		Q6ZRG5	221 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ITIH5	Q86UX2	942 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425		Q8NBF4	154 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	C18orf12	Q96KH6	178 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	TAAR6	Q96RI8	345 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	IWS1	Q96ST2	819 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	LGMN	Q99538	433 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	SIRPD	Q9H106	197 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	NMUR1	Q9HB89	426 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	FBP2	O00757	339 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	SNAP91	O60641	907 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	TGFA	P01135	160 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	CXCL10	P02778	98 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	PROS1	P07225	676 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	FH	P07954	510 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	DPEP1	P16444	411 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	RPA1	P27694	616 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	PRDX6	P30041	224 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	PPP2R1A	P30153	589 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	AKT2	P31751	481 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	CCL11	P51671	97 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ZNF146	Q15072	292 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	UPP1	Q16831	310 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	KDM8	Q8N371	416 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	AGAP3	Q96P47	875 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	PARL	Q9H300	379 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	HPS4	Q9NQG7	708 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	IGLON5	A6NGN9	336 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ASB14	A6NK59	587 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	MEI4	A8MW99	385 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	C19orf81	C9J6K1	198 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425		H7C423	109 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	SOCS3	O14543	225 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	SH2D1B	O14796	132 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	B3GALNT1	O75752	331 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	APRT	P07741	180 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	TRIM49	P0CI25	452 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	TRIM49C	P0CI26	452 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	GHR	P10912	638 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	IL10	P22301	178 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ZNF131	P52739	623 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	SLC26A5	P58743	744 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91

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