RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591971.5

PDE4A-208, Transcript of phosphodiesterase 4A, human

TSL 5

Gene PDE4A, Length 836 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4A-208	ENST00000591971	JAK1	P23458	1154 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	PPP2R1B	P30154	601 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	DCT	P40126	519 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	MLF1	P58340	268 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	BTN3A2	P78410	334 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	LCP2	Q13094	533 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	CHIT1	Q13231	466 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	MPP2	Q14168	576 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	UNC50	Q53HI1	259 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	SIAH3	Q8IW03	269 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	LGI4	Q8N135	537 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	MGARP	Q8TDB4	240 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	CSF3R	Q99062	836 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	SNX6	Q9UNH7	406 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4A-208	ENST00000591971	CREBBP	Q92793	2442 aa		11.65	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		11.65	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	WDR91	A4D1P6	747 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	KLF11	O14901	512 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	CRCP	O75575	148 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	CHN1	P15882	459 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	LIM2	P55344	173 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	RAB38	P57729	211 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	SKP1	P63208	163 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	OR1C1	Q15619	314 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	CHI3L2	Q15782	390 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	MED27	Q6P2C8	311 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	OR2L5	Q8NG80	312 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	FRMD6	Q96NE9	622 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	TMEM237	Q96Q45	408 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	ZNF382	Q96SR6	550 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	CCT7	Q99832	543 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	THAP1	Q9NVV9	213 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	TACC2	O95359	2948 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	VPS13C	Q709C8	3753 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971		A8MUA0	341 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	CDK2AP1	O14519	115 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	ESRRB	O95718	433 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	HSPA4L	O95757	839 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	KRT6A	P02538	564 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	KRT6B	P04259	564 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	SP1	P08047	785 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	FGF4	P08620	206 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	CERS1	P27544	350 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	KRT6C	P48668	564 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	CDH13	P55290	713 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	RCN2	Q14257	317 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	FJX1	Q86VR8	437 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	LAS2	Q8IYD9	372 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	RNF175	Q8N4F7	328 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	SLC5A8	Q8N695	610 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	CCT6B	Q92526	530 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	F2RL3	Q96RI0	385 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	CENPK	Q9BS16	269 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	MECR	Q9BV79	373 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4A-208	ENST00000591971	MS4A8	Q9BY19	250 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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