RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575783.5

CTDNEP1-211, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-211ENST00000575783 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.024e-7■■■■■ 34.6
CTDNEP1-211ENST00000575783 TOMM20Q15388 145 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 SEL1L2Q5TEA6 688 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 VASNQ6EMK4 673 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 C4orf22Q6V702 233 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF721Q8TF20 911 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 ATL1Q8WXF7 558 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 FBXL8Q96CD0 374 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 HES6Q96HZ4 224 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 CALHM2Q9HA72 323 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 FBXO5Q9UKT4 447 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 LRIT2A6NDA9 550 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 SIAH2O43255 324 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 TPSB2P20231 275 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 CERS1P27544 350 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 MSH2P43246 934 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 PTH2RP49190 550 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 AP1S2P56377 157 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 CDK16Q00536 496 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 TPSAB1Q15661 275 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 LYPD8Q6UX82 237 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 WDYHV1Q96HA8 205 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF597Q96LX8 424 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 QRFPRQ96P65 431 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 TAS2R13Q9NYV9 303 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 DAPP1Q9UN19 280 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 SLC22A14Q9Y267 594 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 TESMINQ9Y4I5 508 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 EML6Q6ZMW3 1958 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 SNPHO15079 494 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 CTIFO43310 598 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 SERPINB3P29508 390 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 CPOXP36551 454 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 RPL21P46778 160 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 NR1H2P55055 460 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 SARNPP82979 210 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 KRTAP1-1Q07627 177 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 DMTNQ08495 405 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 SERTAD2Q14140 314 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 RCAN2Q14206 197 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 RCN2Q14257 317 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 DCST1Q5T197 706 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 KIAA1328Q86T90 577 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 C9orf40Q8IXQ3 194 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 GPATCH11Q8N954 259 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 NUBPLQ8TB37 319 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 SLC44A1Q8WWI5 657 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 DIO2Q92813 273 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 GNRHR2Q96P88 292 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 SERINC2Q96SA4 455 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 SFXN3Q9BWM7 321 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 UGT2B28Q9BY64 529 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 GSX2Q9BZM3 304 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 KLHL28Q9NXS3 571 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 MAGEB16A2A368 324 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 DEFB108AA8MXU0 73 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 COX7A2P14406 83 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 SLCO1A2P46721 670 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 CDK9P50750 372 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 MTTPP55157 894 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 CDKN2DP55273 166 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 IL2P60568 153 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 EIPR1Q53HC9 387 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 PLXDC2Q6UX71 529 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 C20orf204Q6ZNR8 217 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 SLC15A4Q8N697 577 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF441Q8N8Z8 693 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 CALML6Q8TD86 181 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 DOK4Q8TEW6 326 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 GAL3ST4Q96RP7 486 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 SDR42E2A6NKP2 422 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 HRKO00198 91 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 HPNP05981 417 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 FBXO45P0C2W1 286 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 CYP4B1P13584 511 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 KCNJ1P48048 391 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms