RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338045.7

LIMS1-202, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-202ENST00000338045 CPN2P22792 545 aa14.6□□□□□ -0.07
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LIMS1-202ENST00000338045 ZNF528Q3MIS6 628 aa14.6□□□□□ -0.07
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LIMS1-202ENST00000338045 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
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LIMS1-202ENST00000338045 PYURFQ96I23 114 aa14.58□□□□□ -0.08
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