RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 LOC100653049A0A140TA62 436 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TRPC5OSA6NMA1 111 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 COQ9O75208 318 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CIB2O75838 187 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 FAM155BO75949 473 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 KRT34O76011 436 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TSPAN12O95859 305 aa4.21□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 LAMA3Q16787 3333 aa4.21□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 SFTPDP35247 375 aa4.21□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 C7orf57Q8NEG2 295 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 OR1L3Q8NH93 324 aa4.21□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 CTSFQ9UBX1 484 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CACNA1DQ01668 2161 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 FAM234BA2RU67 622 aa4.21□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1CAP62136 330 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CLCQ05315 142 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 KEAP1Q14145 624 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 DOC2AQ14183 400 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGAP19Q14CB8 494 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM201Q5SNT2 666 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 GARNL3Q5VVW2 1013 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A25Q6KCM7 469 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 COMMD2Q86X83 199 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF527Q8NB42 609 aa4.21□□□□□ -1.74
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