RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	ART1	P52961	327 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	PMPCA	Q10713	525 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	RUNX2	Q13950	521 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	XKR6	Q5GH73	641 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	GALNT7	Q86SF2	657 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	GPATCH11	Q8N954	259 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM47B	Q8NA70	645 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	TRPV3	Q8NET8	790 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2M7	Q8NG81	312 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	ATL1	Q8WXF7	558 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	RND1	Q92730	232 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	CERS2	Q96G23	380 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	POM121	Q96HA1	1249 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	CSF3R	Q99062	836 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	SOX3	P41225	446 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	BTN3A2	P78410	334 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF460	Q14592	562 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF559	Q9BR84	538 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	URAD	A6NGE7	173 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	USP27X	A6NNY8	438 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338		A8MVJ9	347 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	TTC4	O95801	387 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	CELA3A	P09093	270 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	CD1E	P15812	388 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	SAT1	P21673	171 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	CERS1	P27544	350 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	GDF5	P43026	501 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	HSD17B7	P56937	341 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB38	P57729	211 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	CCZ1B	P86790	482 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC13A2	Q13183	592 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	RTL6	Q6ICC9	239 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	CFAP36	Q96G28	342 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	PWWP2A	Q96N64	755 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	QRFPR	Q96P65	431 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	RASL10B	Q96S79	203 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	HPF1	Q9NWY4	346 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	VWA7	Q9Y334	891 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	PSAT1	Q9Y617	370 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	LRIT2	A6NDA9	550 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	WWP2	O00308	870 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	CYR61	O00622	381 aa		11.07	□□□□□ -0.64

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