RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467080.1

RBM17-208, Transcript of RNA binding motif protein 17, human

TSL 2

Gene RBM17, Length 837 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM17-208	ENST00000467080	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	OR10A4	Q9H209	315 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	GCNT4	Q9P109	453 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	ASB3	Q9Y575	518 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	CREBBP	Q92793	2442 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	LRBA	P50851	2863 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	ITPR3	Q14573	2671 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	TMEM178B	H3BS89	294 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	MAP2K7	O14733	419 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	OGG1	O15527	345 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	AP5Z1	O43299	807 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	PLPP2	O43688	288 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	SLC22A3	O75751	556 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	HIST1H2AB	P04908	130 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	HIST1H2AD	P20671	130 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	NAMPT	P43490	491 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	SLC15A1	P46059	708 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	LMAN1	P49257	510 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	KRT83	P78385	493 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	IL9R	Q01113	521 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	TSPY1	Q01534	308 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	PCLAF	Q15004	111 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	ZBTB6	Q15916	424 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	KYNU	Q16719	465 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080		Q75L30	129 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	DAW1	Q8N136	415 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	GPATCH11	Q8N954	259 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	NR4A3	Q92570	626 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	PHF21A	Q96BD5	680 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	SENP8	Q96LD8	212 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	GCNA	Q96QF7	691 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	OR2A14	Q96R47	310 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	WASH3P	C4AMC7	463 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	GPC4	O75487	556 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	CYP11B2	P19099	503 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	CYP2F1	P24903	491 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	MSH2	P43246	934 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	DNAJC3	Q13217	504 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	HLA-B	Q31612	363 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	TMEM198	Q66K66	360 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	ITIH5	Q86UX2	942 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	ERICH1	Q86X53	443 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	VSIG1	Q86XK7	387 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	SLC5A8	Q8N695	610 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	PLK3	Q9H4B4	646 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	FBXL17	Q9UF56	701 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	TTC26	A0AVF1	554 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080		K7ERI5	159 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	CTDSP2	O14595	271 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	SYNGR3	O43761	229 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	FGF19	O95750	216 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	HSPA4L	O95757	839 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	IGHV4-39	P01824	125 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	MCF2	P10911	925 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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