RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 C6orf136Q5SQH8 315 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 PPP1R3BQ86XI6 285 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 OR4N4Q8N0Y3 316 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 MS4A6EQ96DS6 147 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 SMIM10Q96HG1 83 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 FCRL1Q96LA6 429 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 AKTIPQ9H8T0 292 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 KCNK13Q9HB14 408 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 A0A0G2JND7 137 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 HYKKA2RU49 373 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 TMEM150CB9EJG8 249 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 H3BMH7 237 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 CSO75390 466 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 DDX5P17844 614 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 ALOX12P18054 663 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 EPHA3P29320 983 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 MTTPP55157 894 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 CYP4F2P78329 520 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 KCNC4Q03721 635 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 HYAL2Q12891 473 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 C16orf72Q14CZ0 275 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 KIAA0040Q15053 153 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 GSTA3Q16772 222 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 OR4C11Q6IEV9 310 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 CGB2Q6NT52 195 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 PRMT9Q6P2P2 845 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 ABHD17CQ6PCB6 329 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 CEACAM20Q6UY09 585 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 MAVSQ7Z434 540 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 NUDT13Q86X67 352 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 SPACA3Q8IXA5 215 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 BMPERQ8N8U9 685 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 C7orf57Q8NEG2 295 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 RFWD2Q8NHY2 731 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 BCAS4Q8TDM0 211 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 C10orf82Q8WW14 230 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 STARD8Q92502 1023 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 C3orf30Q96M34 536 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 RILPQ96NA2 401 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 OR6C1Q96RD1 312 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 SERINC2Q96SA4 455 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 NDC1Q9BTX1 674 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 DDA1Q9BW61 102 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 OR51B5Q9H339 312 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 RABEP2Q9H5N1 569 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 ANKHQ9HCJ1 492 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 PRDM9Q9NQV7 894 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 IRAK4Q9NWZ3 460 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 MS4A12Q9NXJ0 267 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 MCM8Q9UJA3 840 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 DCTN4Q9UJW0 460 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 MGAQ8IWI9 3026 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 ARHGAP10A1A4S6 786 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 BLACEA4D250 179 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 EFCAB7A8K855 629 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 H0YIG0 161 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 PLPP1O14494 284 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 NDUFAB1O14561 156 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 UBDO15205 165 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 ERI3O43414 337 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 NRP2O60462 931 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 PRAMEF10O60809 474 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 CCDC22O60826 627 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 PEX11AO75192 247 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 NSA2O95478 260 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 JUNP05412 331 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 IDO1P14902 403 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 RPL3P39023 403 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 SSR2P43308 183 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 ASMTP46597 345 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 GCGRP47871 477 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 AVPR1BP47901 424 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms