RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474230.5

NFU1-209, Transcript of NFU1 iron-sulfur cluster scaffold, human

TSL 3

Gene NFU1, Length 666 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFU1-209	ENST00000474230	TCF4	P15884	667 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	SHC1	P29353	583 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	RFC4	P35249	363 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	ZNF273	Q14593	569 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	P2RX5	Q93086	422 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	PYCR2	Q96C36	320 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	IL16	Q14005	1332 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	NHS	Q6T4R5	1651 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	RREB1	Q92766	1687 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	CETN2	P41208	172 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	SLC8A3	P57103	927 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	RAPSN	Q13702	412 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	FAM219A	Q8IW50	185 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	LRRC15	Q8TF66	581 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	IL36A	Q9UHA7	158 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	KDR	P35968	1356 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230		F8VVB4	439 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230		F8VWA3	439 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230		K7EQD1	137 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	SURF4	O15260	269 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	EPOR	P19235	508 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	AADAC	P22760	399 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	PSMA3	P25788	255 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	PDHA2	P29803	388 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	PAX8	Q06710	450 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	TEF	Q10587	303 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	RBBP7	Q16576	425 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	SPINK14	Q6IE38	97 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	METTL4	Q8N3J2	472 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	AMER3	Q8N944	861 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	PGM2	Q96G03	612 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	MEGF6	O75095	1541 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	BTAF1	O14981	1849 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	SHISA7	A6NL88	538 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	SLC1A7	O00341	560 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	CYTIP	O60759	359 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	ACADS	P16219	412 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	PTAFR	P25105	342 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	SFTPD	P35247	375 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	RGS7	P49802	495 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	MFAP3	P55082	362 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	MS4A2	Q01362	244 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	KCTD2	Q14681	263 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	TAZ	Q16635	292 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NFU1-209	ENST00000474230	KIF18A	Q8NI77	898 aa		4.09	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms