RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295887.5

CDS1-201, Transcript of CDP-diacylglycerol synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDS1, Length 4,461 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDS1-201ENST00000295887 LIPKQ5VXJ0 399 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 FAM219BQ5XKK7 198 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 TUBA3EQ6PEY2 450 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 GPR26Q8NDV2 337 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 GLYATL1Q969I3 302 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 RELTQ969Z4 430 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 RGMAQ96B86 450 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 RTP3Q9BQQ7 232 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 ACPTQ9BZG2 426 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 MED28Q9H204 178 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 TMEM27Q9HBJ8 222 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 PRSS21Q9Y6M0 314 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 ABCA3Q99758 1704 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 CCL5P13501 91 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 PORP16435 677 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 PIK3CBP42338 1070 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 KHKP50053 298 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 CTSL3PQ5NE16 218 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 POMZP3Q6PJE2 187 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 ZNF783Q6ZMS7 281 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 PEX5LQ8IYB4 626 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 SLC22A4Q9H015 551 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 MAGIXQ9H6Y5 334 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 M0R129 80 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 GADD45AP24522 165 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 MLLT10P55197 1068 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 GABARAPL2P60520 117 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 BNC1Q01954 994 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 FAM220AQ7Z4H9 259 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 COMMD2Q86X83 199 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 NAGSQ8N159 534 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 OVCA2Q8WZ82 227 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 IFT27Q9BW83 186 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 MTG2Q9H4K7 406 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 HEBP1Q9NRV9 189 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 CD300AQ9UGN4 299 aa16■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 RIIAD1A6NNX1 92 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 E7EQ34 232 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 ARNTLO00327 626 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 HIST1H2ABP04908 130 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 ALPPP05187 535 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 CYBAP13498 195 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 CD1EP15812 388 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 CPN2P22792 545 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 CMPK1P30085 196 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 GPR68Q15743 365 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 NADSYN1Q6IA69 706 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 VITQ6UXI7 678 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 CHST14Q8NCH0 376 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 SNX33Q8WV41 574 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 HIST1H2ACQ93077 130 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 SOHLH2Q9NX45 425 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 ERVK13-1Q9NX77 482 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 POLR1DQ9Y2S0 133 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 OR6C70A6NIJ9 312 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 KIAA0513O60268 411 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 LRRC32Q14392 662 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 RUNDC3AQ59EK9 446 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 ZNF311Q5JNZ3 666 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 ZFP90Q8TF47 636 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 C17orf62Q9BQA9 187 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 TTLL2Q9BWV7 592 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 DSN1Q9H410 356 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 OCEL1Q9H607 264 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 NECTIN3Q9NQS3 549 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 IKZF2Q9UKS7 526 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 DAPL1A0PJW8 107 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 FAM170BA6NMN3 283 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 I6L893 689 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 ADAM12O43184 909 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 SLC35G6P0C7Q6 338 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 TACR1P25103 407 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 TBPL1P62380 186 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 SKP1P63208 163 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 GINS1Q14691 196 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 RTL4Q6ZR62 310 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 SCRN2Q96FV2 425 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 SACM1LQ9NTJ5 587 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 TAS2R7Q9NYW3 318 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 KCNK6Q9Y257 313 aa15.99■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 ORC5O43913 435 aa15.98■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 SPINT3P49223 89 aa15.98■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 LGALS3BPQ08380 585 aa15.98■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 ARL9Q6T311 187 aa15.98■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 TAS1R1Q7RTX1 841 aa15.98■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa15.98■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 FAM217AQ8IXS0 508 aa15.98■□□□□ 0.15
CDS1-201ENST00000295887 BEX2Q9BXY8 128 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms